RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.91■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAI14Q9P0K7 980 aa25.91■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.91■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HAND2P61296 217 aa25.9■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARMT1Q9H993 441 aa25.9■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.9■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APPP05067 770 aa25.9■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP7A1P22680 504 aa25.9■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NECAB1Q8N987 351 aa25.9■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.9■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBPF3Q9H094 633 aa25.9■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.9■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP2B4P23634 1241 aa25.89■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPSM2P81274 684 aa25.89■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.89■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LCORLQ8N3X6 602 aa25.89■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.89■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.88■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.88■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCOA7Q8NI08 942 aa25.88■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRF1Q92994 677 aa25.88■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTF3C6Q969F1 213 aa25.88■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.88■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMP10P09238 476 aa25.87■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSE1Q14687 1217 aa25.87■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.87■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC51AQ86UW1 340 aa25.87■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJB2P29033 226 aa25.87■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGD1P98174 961 aa25.87■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.87■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.87■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAPBQ9H115 298 aa25.87■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.87■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SRGNP10124 158 aa25.86■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCM5P33992 734 aa25.86■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EVCP57679 992 aa25.86■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF384Q8TF68 577 aa25.86■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.86■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.85■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GGA1Q9UJY5 639 aa25.85■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.85■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPR1P16066 1061 aa25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYT1P21579 422 aa25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE6BP35913 854 aa25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC15A2Q16348 729 aa25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D10CQ8IV04 446 aa25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SP8Q8IXZ3 490 aa25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STX6O43752 255 aa25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRAK2O60296 914 aa25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PFKFB2O60825 505 aa25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UFL1O94874 794 aa25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRDNQ13061 729 aa25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRC1O43663 620 aa25.82■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRKAB2O43741 272 aa25.82■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MECOMQ03112 1051 aa25.82■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANTXR2P58335 489 aa25.82■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.82■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STK3Q13188 491 aa25.81■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.81■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.81■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STK32BQ9NY57 414 aa25.81■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL1R1P14778 569 aa25.8■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDCP20941 246 aa25.8■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRDX5P30044 214 aa25.8■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALDH1B1P30837 517 aa25.8■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TDO2P48775 406 aa25.8■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APOBRQ0VD83 1088 aa25.8■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHST3Q7LGC8 479 aa25.8■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCRN1Q12765 414 aa25.79■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCTP1Q6DN14 999 aa25.79■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MSL1Q68DK7 614 aa25.79■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.79■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MASTLQ96GX5 879 aa25.79■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.79■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD209Q9NNX6 404 aa25.79■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLLQ9UGP5 575 aa25.79■■□□□ 1.72
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.3 ms