RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 MAST3O60307 1309 aa26.63■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 YDJCA8MPS7 323 aa26.62■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 CYP7A1P22680 504 aa26.62■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 RASSF7Q02833 373 aa26.62■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 GRIK5Q16478 980 aa26.62■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.62■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 NIM1KQ8IY84 436 aa26.62■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 COL4A5P29400 1685 aa26.62■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 USP17L3A6NCW0 530 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 USP17L4A6NCW7 530 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 M0R2C6 588 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 ZNF384Q8TF68 577 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 USP26Q9BXU7 913 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 JDP2Q8WYK2 163 aa26.6■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 SBF1O95248 1867 aa26.6■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.6■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.6■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 DACT2Q5SW24 774 aa26.59■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 CERS5Q8N5B7 392 aa26.59■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 MXD3Q9BW11 206 aa26.59■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.59■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 UTRNP46939 3433 aa26.59■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
CTU2-201ENST00000312060 GPAA1O43292 621 aa26.57■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.845e-7■□□□□ 9.2
CTU2-201ENST00000312060 GSTO1P78417 241 aa26.57■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 ADGRA1Q86SQ6 560 aa26.57■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 AIDAQ96BJ3 306 aa26.57■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 PTH1RQ03431 593 aa26.57■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 PRELPP51888 382 aa26.56■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 MIGA1Q8NAN2 632 aa26.56■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.56■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 RAD17O75943 681 aa26.55■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 LDHCP07864 332 aa26.55■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 F8W031 263 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.54■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 MAP4K1Q92918 833 aa26.54■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa26.54■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 MBD4O95243 580 aa26.54■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 VPS53Q5VIR6 699 aa26.54■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 SLF2Q8IX21 1173 aa26.54■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 PSMD14O00487 310 aa26.53■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 ARMT1Q9H993 441 aa26.53■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 LMNB1P20700 586 aa26.52■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 LCORLQ8N3X6 602 aa26.52■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 DSCC1Q9BVC3 393 aa26.52■■□□□ 1.84
CTU2-201ENST00000312060 MCCP23508 829 aa26.51■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 CXCL9Q07325 125 aa26.51■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.51■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.51■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 GPR162Q16538 588 aa26.5■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.5■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 GNAT2P19087 354 aa26.5■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.5■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 BAG3O95817 575 aa26.48■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 HSPA4P34932 840 aa26.48■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 SCNN1DP51172 638 aa26.48■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 TNIP1Q15025 636 aa26.48■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 FZD9O00144 591 aa26.47■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 APPP05067 770 aa26.47■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 MRIQ9BWK5 157 aa26.47■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.47■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 GAKO14976 1311 aa26.47■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.47■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 FOXP2O15409 715 aa26.47■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 PPP4CP60510 307 aa26.47■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 NECTIN1Q15223 517 aa26.47■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 TEKT1Q969V4 418 aa26.47■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.46■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 PRKAB2O43741 272 aa26.46■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.46■■□□□ 1.83
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
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