RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 SOX10P56693 466 aa24.61■■□□□ 1.53
CXCL3-201ENST00000296026 GRIK5Q16478 980 aa24.61■■□□□ 1.53
CXCL3-201ENST00000296026 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CXCL3-201ENST00000296026 IFNL1Q8IU54 200 aa24.6■■□□□ 1.53
CXCL3-201ENST00000296026 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.6■■□□□ 1.53
CXCL3-201ENST00000296026 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.6■■□□□ 1.53
CXCL3-201ENST00000296026 FKTNO75072 461 aa24.59■■□□□ 1.53
CXCL3-201ENST00000296026 BCAMP50895 628 aa24.59■■□□□ 1.53
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.59■■□□□ 1.53
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.59■■□□□ 1.53
CXCL3-201ENST00000296026 LAMB1P07942 1786 aa24.58■■□□□ 1.53
CXCL3-201ENST00000296026 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.58■■□□□ 1.53
CXCL3-201ENST00000296026 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 TNNI2P48788 182 aa24.57■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.57■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 TEPSINQ96N21 525 aa24.57■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 FGFR2P21802 821 aa24.56■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 GJA5P36382 358 aa24.56■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.56■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 OTOFQ9HC10 1997 aa24.56■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 EYA2O00167 538 aa24.55■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 TEKT1Q969V4 418 aa24.55■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 ELP3Q9H9T3 547 aa24.55■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 KIF16BQ96L93 1317 aa24.55■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 OPTNQ96CV9 577 aa24.53■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 SLC5A1P13866 664 aa24.52■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 CACNB3P54284 484 aa24.52■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.52■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 LPIN2Q92539 896 aa24.52■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.52■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 MRIQ9BWK5 157 aa24.52■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CXCL3-201ENST00000296026 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.51■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.51■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 MAST3O60307 1309 aa24.51■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 MAP3K9P80192 1104 aa24.5■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 PTPN18Q99952 460 aa24.5■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.5■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 CRHR2Q13324 411 aa24.49■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 VGLL4Q14135 290 aa24.49■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.49■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 SIL1Q9H173 461 aa24.49■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.49■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.48■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.48■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.48■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO3Q9UK99 471 aa24.48■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM17Q9Y577 477 aa24.48■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 CSADQ9Y600 493 aa24.48■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 CIAO1O76071 339 aa24.47■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 FAM83AQ86UY5 434 aa24.47■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 ATP2B3Q16720 1220 aa24.46■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 FKBP1CQ5VVH2 108 aa24.46■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.46■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.46■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CXCL3-201ENST00000296026 OTUD5Q96G74 571 aa24.45■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 ERO1AQ96HE7 468 aa24.45■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.45■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 GTF2A2P52657 109 aa24.44■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.44■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.44■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 HOOK2Q96ED9 719 aa24.44■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.43■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 CCER2I3L3R5 266 aa24.43■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 CCL15Q16663 113 aa24.43■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 WRNIP1Q96S55 665 aa24.43■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 MEIS3Q99687 375 aa24.43■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.42■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 SP3Q02447 781 aa24.42■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.42■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.42■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 PRDX5P30044 214 aa24.41■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.41■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 PHKA1P46020 1223 aa24.4■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 DCAF15Q66K64 600 aa24.4■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 ERO1BQ86YB8 467 aa24.4■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 COPRSQ9NQ92 184 aa24.4■■□□□ 1.5
CXCL3-201ENST00000296026 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms