RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259351.9

RALGPS1-201, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 6,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-201ENST00000259351 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.58□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 NEK11Q8NG66 645 aa14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 TIGD1Q96MW7 591 aa14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 C8orf37Q96NL8 207 aa14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 LETM2Q2VYF4 491 aa14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 TNNI3KQ59H18 835 aa14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 OGFOD1Q8N543 542 aa14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 PLVAPQ9BX97 442 aa14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 ABCC1P33527 1531 aa14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 DPH6Q7L8W6 267 aa14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 VPS18Q9P253 973 aa14.57□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 SP4Q02446 784 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 ARMT1Q9H993 441 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 EYA2O00167 538 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 STAMBPO95630 424 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 VPS16Q9H269 839 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 TLDC2A0PJX2 215 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 PLCB3Q01970 1234 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 FAM212AQ96EL1 285 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 MYL10Q9BUA6 226 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 ZEB2O60315 1214 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 FAM13AO94988 1023 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 IL13P35225 146 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 ZNF790Q6PG37 636 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 IP6K1Q92551 441 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 HS1BP3Q53T59 392 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 FBF1Q8TES7 1133 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 GTF3C6Q969F1 213 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 BICDL2A1A5D9 508 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 SGSM2O43147 1006 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 ITGA6P23229 1130 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 USP19O94966 1318 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 ELP1O95163 1332 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 GNA11P29992 359 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 ASXL2Q76L83 1435 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.55□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 USP37Q86T82 979 aa14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 ANO1Q5XXA6 986 aa14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 A1BGP04217 495 aa14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 XAGE2Q96GT9 111 aa14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 SUCLG2Q96I99 432 aa14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 ERCC3P19447 782 aa14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC25Q86WR0 208 aa14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.54□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 CHL1O00533 1208 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 HSPA4P34932 840 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 GPAA1O43292 621 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 OPA1O60313 960 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 PHKBQ93100 1093 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 TRAF5O00463 557 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 JAK2O60674 1132 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 EVCP57679 992 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 ZFYVE9O95405 1425 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 TAF5LO75529 589 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 UIMC1Q96RL1 719 aa14.53□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.52□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 NYXQ9GZU5 481 aa14.52□□□□□ -0.08
RALGPS1-201ENST00000259351 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms