RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 FANCLQ9NW38 375 aa24.41■■□□□ 1.5
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ODC1-201ENST00000234111 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.41■■□□□ 1.5
ODC1-201ENST00000234111 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
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ODC1-201ENST00000234111 STX10O60499 249 aa24.4■■□□□ 1.5
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ODC1-201ENST00000234111 ZNF609O15014 1411 aa24.36■■□□□ 1.49
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ODC1-201ENST00000234111 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.33■■□□□ 1.48
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ODC1-201ENST00000234111 KCNQ3O43525 872 aa24.32■■□□□ 1.48
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ODC1-201ENST00000234111 CXorf56Q9H5V9 222 aa24.31■■□□□ 1.48
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ODC1-201ENST00000234111 USP6P35125 1406 aa24.31■■□□□ 1.48
ODC1-201ENST00000234111 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.31■■□□□ 1.48
ODC1-201ENST00000234111 ANO1Q5XXA6 986 aa24.31■■□□□ 1.48
ODC1-201ENST00000234111 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.31■■□□□ 1.48
ODC1-201ENST00000234111 C8orf76Q96K31 380 aa24.31■■□□□ 1.48
ODC1-201ENST00000234111 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.31■■□□□ 1.48
ODC1-201ENST00000234111 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.31■■□□□ 1.48
ODC1-201ENST00000234111 MED4Q9NPJ6 270 aa24.31■■□□□ 1.48
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