RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227520.9

CCDC86-201, Transcript of coiled-coil domain containing 86, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC86, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86-201ENST00000227520 PDLIM2Q96JY6 352 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 BOLA2Q9H3K6 86 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 COPRSQ9NQ92 184 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 SCN9AQ15858 1988 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 GLTPD2A6NH11 291 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 FZD9O00144 591 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 CHRNDQ07001 517 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 NIM1KQ8IY84 436 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 VPS33BQ9H267 617 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 NMRK2Q9NPI5 230 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 PSME4Q14997 1843 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 RIMBP2O15034 1052 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 WASHC4Q2M389 1173 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 HS1BP3Q53T59 392 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 ZSCAN30Q86W11 494 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 CCDC83Q8IWF9 413 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 FSD1Q9BTV5 496 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 TCHHQ07283 1943 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 A0A0D9SFI3 127 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 SLC27A2O14975 620 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 F13A1P00488 732 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 KCNJ4P48050 445 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 EYA3Q99504 573 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 ATP2B4P23634 1241 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 TSPY26PQ9H489 355 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 CNPY2Q9Y2B0 182 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 MED23Q9ULK4 1368 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 TAF5LO75529 589 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 ATP5JP18859 108 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 PSMA5P28066 241 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 GJB2P29033 226 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 DBNDD1Q9H9R9 158 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 SCN4AP35499 1836 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC86-201ENST00000227520 YDJCA8MPS7 323 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 ST3GAL1Q11201 340 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 ME3Q16798 604 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 LRRC24Q50LG9 513 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 SNAP23O00161 211 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 KLRK1P26718 216 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 TFCP2Q12800 502 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 DOK7Q18PE1 504 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 TNNI3KQ59H18 835 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 RNF20Q5VTR2 975 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 ZNRF3Q9ULT6 936 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 MTMR6Q9Y217 621 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 KIF3CO14782 793 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 EIF6P56537 245 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 RRAGCQ9HB90 399 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 ECE2O60344 883 aa16.81■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 UBE2HP62256 183 aa16.81■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.81■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.81■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 POTECB2RU33 542 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 CXCL9Q07325 125 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 TSGA10IPQ3SY00 556 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 NECAB1Q8N987 351 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 GJA3Q9Y6H8 435 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 IRS2Q9Y4H2 1338 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 RAD17O75943 681 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 ANKRD1Q15327 319 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 GPC2Q8N158 579 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 RNF214Q8ND24 703 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 HMG20BQ9P0W2 317 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16.79■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 RPS6KB1P23443 525 aa16.79■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 KCNQ5Q9NR82 932 aa16.79■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 FBXO3Q9UK99 471 aa16.79■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 RFX7Q2KHR2 1363 aa16.79■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 EYA2O00167 538 aa16.78■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.78■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 METTL24Q5JXM2 366 aa16.78■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.78■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CCDC86-201ENST00000227520 TAF6LQ9Y6J9 622 aa16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.7 ms