RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pde3bQ61409 1100 aa26.46■■□□□ 1.83
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scn10aQ6QIY3 1958 aa26.46■■□□□ 1.83
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ripk3Q9QZL0 486 aa26.44■■□□□ 1.82
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Il17raQ60943 864 aa26.39■■□□□ 1.82
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cog6Q8R3I3 657 aa26.39■■□□□ 1.82
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fgl2P12804 432 aa26.37■■□□□ 1.81
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa26.36■■□□□ 1.81
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Map3k12Q60700 888 aa26.35■■□□□ 1.81
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sirt2Q8VDQ8 389 aa26.35■■□□□ 1.81
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prr14lE9Q7C4 1971 aa26.35■■□□□ 1.81
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Traf5P70191 558 aa26.34■■□□□ 1.81
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pla2g4fQ50L41 855 aa26.34■■□□□ 1.81
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mkrn1Q9QXP6 481 aa26.34■■□□□ 1.81
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm3893E9Q1I1 302 aa26.33■■□□□ 1.81
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krt40Q6IFX3 439 aa26.33■■□□□ 1.81
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnf181Q9CY62 165 aa26.33■■□□□ 1.81
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Uba5Q8VE47 403 aa26.32■■□□□ 1.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col20a1Q923P0 1320 aa26.32■■□□□ 1.8
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ParnQ8VDG3 624 aa26.31■■□□□ 1.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mansc4Q3UU94 337 aa26.3■■□□□ 1.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AsnsQ61024 561 aa26.3■■□□□ 1.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Snap47Q8R570 413 aa26.3■■□□□ 1.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bcs1lQ9CZP5 418 aa26.3■■□□□ 1.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q9D2X8 372 aa26.3■■□□□ 1.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CalcaP70160 136 aa26.29■■□□□ 1.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trpv1Q704Y3 839 aa26.29■■□□□ 1.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CenppQ9CZ92 286 aa26.29■■□□□ 1.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 S1pr4Q9Z0L1 386 aa26.29■■□□□ 1.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adam7O35227 789 aa26.28■■□□□ 1.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bcorl1A2AQH4 1781 aa26.28■■□□□ 1.8
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