RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641601.1

SAMMSON-218, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,847 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-218ENST00000641601 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.46□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.46□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.46□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 S100PBPQ96BU1 408 aa8.46□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 BTF3L4Q96K17 158 aa8.46□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.46□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 PTPRBP23467 1997 aa8.46□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 A0A1B0GWJ7 208 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 LNP1A1A4G5 178 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 MARCH11A6NNE9 402 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 LINC00473A8K010 186 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 C15orf62A8K5M9 175 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 TMPRSS2O15393 492 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 PAGE4O60829 102 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 MPDU1O75352 247 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 LYZL6O75951 148 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 IGKV3-15P01624 115 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 AMBPP02760 352 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 CD59P13987 128 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 SOX8P57073 446 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 LCN2P80188 198 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 Q6ZR03 302 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 Q8N7P7 452 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 C11orf94C9JXX5 98 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 F6UZH7 168 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 C15orf65H3BRN8 121 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 SPINT2O43291 252 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 IGHG3P01860 377 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 ARG2P78540 354 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 REC114Q7Z4M0 266 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 NECAP1Q8NC96 275 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 R3HDM4Q96D70 268 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 C14orf144Q96I85 54 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 IMMP2LQ96T52 175 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.45□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 XKRY2A2RUG3 117 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 HPRT1P00492 218 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 GCGP01275 180 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 CD1BP29016 333 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 DDTP30046 118 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 HOXC12P31275 282 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 SSTR5P35346 364 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 PMP22Q01453 160 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 MZT1Q08AG7 82 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 FOXF2Q12947 444 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 HNF4GQ14541 408 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 Q3ZCU0 254 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 OR52E5Q8NH55 327 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 CHODLQ9H9P2 273 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 PSG11Q9UQ72 335 aa8.44□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 A0A1W2PPQ1 181 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 GZMBP10144 247 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 NPPCP23582 126 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 OPRK1P41145 380 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 TMPRSS3P57727 454 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 SPCS3P61009 180 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 RTP5Q14D33 572 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 LINC01551Q86U37 167 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 LOXL4Q96JB6 756 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 JPT1Q9UK76 154 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 DNAJC13O75165 2243 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 ST8SIA5O15466 376 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 OR9G9P0C7N8 305 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 GPR12P47775 334 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 TNFSF10P50591 281 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 TLE1Q04724 770 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 CR1LQ2VPA4 569 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.43□□□□□ -1.06
SAMMSON-218ENST00000641601 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms