RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	CLEC3B	P05452	202 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	GSTT2	P0CG29	244 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	GSTT2B	P0CG30	244 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	NPY1R	P25929	384 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	HMGN3	Q15651	99 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	C17orf77	Q96MU5	243 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPIN2A	Q99865	258 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	LRRC42	Q9Y546	428 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337		M0R1X1	148 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	BAG2	O95816	211 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	CST1	P01037	141 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	RPA2	P15927	270 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	CAPG	P40121	348 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	EFNB1	P98172	346 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q6ZSN1	163 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A1B0GW64	132 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	HMX3	A6NHT5	357 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	GNGT2	O14610	69 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	ACTL6B	O94805	426 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	ANXA8	P13928	327 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	PSMB6	P28072	239 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	GPR183	P32249	361 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	SOX2	P48431	317 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	DDI2	Q5TDH0	399 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM210B	Q96KR6	192 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR14A2	Q96R54	314 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF221	Q9UK13	617 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM229A	H3BQW9	127 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	ITGB1BP1	O14713	200 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC16A6	O15403	523 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	TGOLN2	O43493	480 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCDC22	O60826	627 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	FUT3	P21217	361 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	CEACAM6	P40199	344 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	MNAT1	P51948	309 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	CBX3	Q13185	183 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	LEMD1	Q68G75	181 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	TEX45	Q8NA69	505 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	DPPA5	A6NC42	116 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337		J3QLW9	94 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	DYNC1I1	O14576	645 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	GLA	P06280	429 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	RAP2A	P10114	183 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF19	P17023	458 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	UBE2K	P61086	200 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	GPR176	Q14439	515 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	PLET1	Q6UQ28	207 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	SSX9	Q7RTT3	188 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	RNF2	Q99496	336 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	ATG101	Q9BSB4	218 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPTAN1-231	ENST00000636337	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		6.94	□□□□□ -1.3

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