RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468		H3BUA1	57 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM127	O75204	238 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	ZP3	P21754	424 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	CD40LG	P29965	261 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	VEGFC	P49767	419 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	SCAND1	P57086	179 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	HLA-DRB3	P79483	266 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	SPCS2	Q15005	226 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	PDPN	Q86YL7	162 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	AK3	Q9UIJ7	227 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	BRI3	O95415	125 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	TRGV3	P03979	118 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	CEACAM6	P40199	344 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	GPR141	Q7Z602	305 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	POC5	Q8NA72	575 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SETD6	Q8TBK2	473 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	CLCC1	Q96S66	551 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468		Q9N2K0	584 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	PALMD	Q9NP74	551 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SPATA2	Q9UM82	520 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SCT	P09683	121 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SERPINB10	P48595	397 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00205	P59089	165 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	FXYD3	Q14802	87 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	IDNK	Q5T6J7	187 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0G2JLM5	398 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A17	O43808	307 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV2-23	P01705	113 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	APOA2	P02652	100 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	TMBIM6	P55061	237 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	ISOC1	Q96CN7	298 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF221	Q9UK13	617 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	ETV7	Q9Y603	341 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468		H3BMQ9	156 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SSX5	O60225	188 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	CRYGB	P07316	175 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	GNB3	P16520	340 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	RAB3C	Q96E17	227 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM68	Q96MH6	324 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	RDH8	Q9NYR8	311 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	TRDC	B7Z8K6	153 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468		H0Y980	276 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468		M0R1X1	148 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	RANBP1	P43487	201 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	LGALS7	P47929	136 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	OR5T1	Q8NG75	326 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SPATA25	Q9BR10	227 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MUC1-222	ENST00000610468	LYST	Q99698	3801 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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