RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 FOXJ2Q9P0K8 574 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 CXorf1O96002 111 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 CELA2AP08217 269 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 TGFBR3Q03167 851 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 MMDQ15546 238 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 NIT1Q86X76 327 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ZNF709Q8N972 641 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 SGCZQ96LD1 299 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PN81 502 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 CARD18P57730 90 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 SSPNQ14714 243 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PS18 150 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 DIRC3C9JPN6 131 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 RRHO14718 337 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ZNF253O75346 499 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 OR5G3P0C626 314 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 DEFA4P12838 97 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 SSR4P51571 173 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 CLDN18P56856 261 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 MLF1P58340 268 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 RHOBP62745 196 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 UBE2V1Q13404 147 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 OR5B3Q8NH48 314 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ZNF488Q96MN9 340 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 UHRF2Q96PU4 802 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 COX11Q9Y6N1 276 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 C20orf202A1L168 122 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 J3QT63 122 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 PPBPP02775 128 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 G6PCP35575 357 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 PRRX1P54821 245 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 GNG3P63215 75 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 CX3CL1P78423 397 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 RPEL1Q2QD12 228 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 WDR73Q6P4I2 378 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ZNF90Q03938 601 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ZNF146Q15072 292 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.25□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.25□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.25□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ABCA7Q8IZY2 2146 aa8.25□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 MGST2Q99735 147 aa8.25□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 NEURL1O76050 574 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 OR2H2O95918 312 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 MYF5P13349 255 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 UBE2G2P60604 165 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 COTL1Q14019 142 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 Q8IYB0 196 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 DEFB119Q8N690 84 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 OR10D3Q8NH80 312 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 TAAR6Q96RI8 345 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 U3KQA8 63 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 SH2D1BO14796 132 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 CXCL13O43927 109 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 TREML4Q6UXN2 200 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 BAGE3Q86Y29 109 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 BAGE2Q86Y30 109 aa8.24□□□□□ -1.09
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