RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0U1RQK1	487 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576		H0YJW9	148 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIMM23	O14925	209 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FSHB	P01225	129 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV1-16	P04430	117 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SERPINE2	P07093	398 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANXA3	P12429	323 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM187	Q14656	261 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	C11orf88	Q6PI97	169 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	MITD1	Q8WV92	249 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR51J1	Q9H342	316 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	NUP50	Q9UKX7	468 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576		H7C2Y5	167 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TXNL1	O43396	289 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	LY6G6D	O95868	133 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	UCP1	P25874	307 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD24	P25063	80 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR8H3	Q8N146	312 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	OOSP1	A8MZH6	123 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSNA1	O43805	119 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDS2	O95674	445 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRYZL1	O95825	349 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	APOA2	P02652	100 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB13	P51153	203 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHB2	Q99623	299 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	B3GALNT1	O75752	331 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	S1PR2	O95136	353 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV1-39	P01597	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV1D-39	P04432	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	LPAR6	P43657	344 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RTL8B	Q17RB0	113 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR4S2	Q8NH73	311 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFHR4	Q92496	578 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	NF1	P21359	2839 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOSL1	P15407	271 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	BPIFB3	P59826	476 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	COQ8A	Q8NI60	647 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SUN5	Q8TC36	379 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM56	Q96MV1	263 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBP1	P09467	338 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPA2	P15927	270 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	MC5R	P33032	325 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIR2DS2	P43631	304 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF695	Q8IW36	515 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	LGI3	Q8N145	548 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC35G3	Q8N808	338 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNC	P24821	2201 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CUBN	O60494	3623 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADAP1	O75689	374 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	VENTX	O95231	258 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRAS	P01116	189 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBLN7	Q53RD9	439 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDPN	Q86YL7	162 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRTM2	Q8N967	370 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RITA1	Q96K30	269 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	DBX1	A6NMT0	343 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	HPRT1	P00492	218 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV1D-33	P01593	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV1-33	P01594	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXB5	P09067	269 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGDIB	P52566	201 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRPX	P78539	464 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	HNF4G	Q14541	408 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		7.36	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms