RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589867.2

MBD1-221, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 1, human

TSL 3

Gene MBD1, Length 673 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MBD1-221	ENST00000589867	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	DUX3	Q96PT4	197 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	P2RX4	Q99571	388 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	CRYZL1	O95825	349 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	PPY	P01298	95 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	LGALS7	P47929	136 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	ARPC4	P59998	168 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	CDK10	Q15131	360 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	RRAS	P10301	218 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	IGLL1	P15814	213 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	PRSS3	P35030	304 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	RFX2	P48378	723 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	PLGLA	Q15195	96 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	RTL8B	Q17RB0	113 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	ECSCR	Q19T08	205 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	GNB4	Q9HAV0	340 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	SHOX	O15266	292 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	SLC22A5	O76082	557 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	MSMO1	Q15800	293 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	KCTD9	Q7L273	389 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	MFSD4A	Q8N468	514 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	IFT46	Q9NQC8	304 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MBD1-221	ENST00000589867	CTDSP2	O14595	271 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	FCGR3B	O75015	233 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	PMP2	P02689	132 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	PF4	P02776	101 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	SLC6A1	P30531	599 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	RAB9A	P51151	201 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	UBE2K	P61086	200 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	FXYD3	Q14802	87 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	ARPC1A	Q92747	370 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	EHF	Q9NZC4	300 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867		A0A1W2PN81	502 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867		I3L521	148 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	CCL24	O00175	119 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	TNFSF12	O43508	249 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	CD33	P20138	364 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	GNRHR	P30968	328 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	CHRNA7	P36544	502 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	MYCNOS	P40205	109 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	TMBIM6	P55061	237 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	FXYD4	P59646	89 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	PRSS8	Q16651	343 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	TEX45	Q8NA69	505 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	ABHD1	Q96SE0	405 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	RAMP3	O60896	148 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	HLA-DMA	P28067	261 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	HRH1	P35367	487 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	GNB1	P62873	340 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	FHL3	Q13643	280 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	MZT2A	Q6P582	158 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MBD1-221	ENST00000589867	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		13.43	□□□□□ -0.26

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