RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 NICN1Q9BSH3 213 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 SYT4Q9H2B2 425 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 LHFPL6Q9Y693 200 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 A0A0G2JRQ6 117 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 TOR1AO14656 332 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 SNAPINO95295 136 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 CST4P01036 141 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 HSD11B1P28845 292 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 RAB13P51153 203 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 SMIM11AP58511 58 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 ESRRGP62508 458 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 RDH10Q8IZV5 341 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 OR6V1Q8N148 313 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 LRRC75AQ8NAA5 344 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 OR5A2Q8NGI9 324 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 OR2T4Q8NH00 348 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 PFN4Q8NHR9 129 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 C17orf50Q8WW18 174 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 RNF170Q96K19 258 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF714Q96N38 554 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 OR4C12Q96R67 309 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 MBOAT4Q96T53 435 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 COPS4Q9BT78 406 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 MFFQ9GZY8 342 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 Q9UF83 564 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 ERGIC3Q9Y282 383 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV27A0A087WT01 109 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1B0GW55 424 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 H0Y980 276 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 FAM3AP98173 230 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 SMARCD3Q6STE5 483 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 TMEM133Q9H2Q1 129 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 OR51J1Q9H342 316 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 TUBA4BQ9H853 241 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.88□□□□□ -1.79
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