RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	SCOC	Q9UIL1	159 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147		J3QRK9	145 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	RAMP3	O60896	148 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	CNIH1	O95406	144 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	CRYGB	P07316	175 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	GNG2	P59768	71 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	RTL8B	Q17RB0	113 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM177	Q53S58	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	IDNK	Q5T6J7	187 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	ARPC1A	Q92747	370 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	SHOX	O15266	292 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	SSX5	O60225	188 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	RRAS	P10301	218 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	CD40LG	P29965	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	CBX3	Q13185	183 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-222	ENST00000567147	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	SCAND1	P57086	179 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	CASC10	Q5T4H9	136 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	OR5T1	Q8NG75	326 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	DDB2	Q92466	427 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	DCUN1D4	Q92564	292 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	PRR25	Q96S07	402 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	ETV7	Q9Y603	341 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	LINC00473	A8K010	186 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	HLA-DQB1	P01920	261 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	ECI1	P42126	302 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	TPPP2	P59282	170 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	RHOV	Q96L33	236 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	LINC01619	G3V211	115 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	CRYZL1	O95825	349 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	TRGV3	P03979	118 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	SLURP1	P55000	103 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	TEX45	Q8NA69	505 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147		A0A087WW49	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	OVOL1	O14753	267 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	TUSC2	O75896	110 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	INSL3	P51460	131 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	UBE2K	P61086	200 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	MUC7	Q8TAX7	377 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147		A0A0A6YYH2	397 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147		A6NJ64	397 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	AIRE	O43918	545 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	FCGR3B	O75015	233 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC22A5	O76082	557 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	IGLV2-14	P01704	120 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	TGFBR1	P36897	503 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	POC5	Q8NA72	575 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147		A0A087WXM4	84 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147		H3BUA1	57 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM127	O75204	238 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	PRSS8	Q16651	343 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF429	Q86V71	674 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	YIPF6	Q96EC8	236 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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