RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 K7EP34 96 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 HMGN4O00479 90 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2G1P62253 170 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TGIF1Q15583 401 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf35Q96D05 121 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PERPQ96FX8 193 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 E9PLN8 166 aa5.44□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 HLA-DRB1P01911 266 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TSPOP30536 169 aa5.44□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SPRED2Q7Z698 418 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01555Q8NAE3 123 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF681Q96N22 645 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.44□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 F2RL2O00254 374 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CHEK1O14757 476 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CTAG2O75638 210 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CRYBB2P43320 205 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 GAS1P54826 345 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 OTPQ5XKR4 325 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 MCM3APO60318 1980 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G2AP14555 144 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ZXDBP98169 803 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 IGFBP7Q16270 282 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 RPEQ96AT9 228 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 IMMP2LQ96T52 175 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 GPR132Q9UNW8 380 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 FNDC10F2Z333 226 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SPRY3O43610 288 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 OR2A4O95047 310 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TOMM40O96008 361 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 SYS1Q8N2H4 156 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 CD160O95971 181 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 IL18BPO95998 194 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00869P0C866 280 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 DHRS2Q13268 280 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 RETNQ9HD89 108 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CMC2Q9NRP2 79 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 GPR27Q9NS67 375 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CES1P1Q9UKY3 287 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 R4GMQ9 66 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 MUC6Q6W4X9 2439 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 A0A096LPE4 126 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PPZ6 126 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ASPDHA6ND91 283 aa5.43□□□□□ -1.54
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