RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 TSC2P49815 1807 aa6.8□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 PTHLHP12272 177 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 MAGEB1P43366 347 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 DLK1P80370 383 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 SMUG1Q53HV7 270 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 PRR27Q6MZM9 219 aa6.78□□□□□ -1.32
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