RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-210ENST00000549362 SYNGR2O43760 224 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CHST1O43916 411 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CYTIPO60759 359 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 RAMP1O60894 148 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 WDR1O75083 606 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 SYNGR4O95473 234 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 NAPSAO96009 420 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 HLA-HP01893 362 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CSN3P07498 182 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 METTL15P1P0C7V9 234 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 BCL2P10415 239 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 DAOP14920 347 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 FGF7P21781 194 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 F2RP25116 425 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 ARR3P36575 388 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 NPBWR2P48146 333 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 PSMB3P49720 205 aa3.63□□□□□ -1.83
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USP25-210ENST00000549362 RAB11AP62491 216 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CCL7P80098 99 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 RPL19P84098 196 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 PSG4Q00888 419 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 MSMO1Q15800 293 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 PIGYQ3MUY2 71 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 TMEM41BQ5BJD5 291 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 NMSQ5H8A3 153 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 NCMAPQ5T1S8 102 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 TSPO2Q5TGU0 170 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 OR2T2Q6IF00 324 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 SLC25A26Q70HW3 274 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 Q75L30 129 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 GAPTQ8N292 157 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 SLC25A45Q8N413 288 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 ZIC4Q8N9L1 334 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 OR10A7Q8NGE5 316 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 OR2AE1Q8NHA4 323 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 AKR7LQ8NHP1 331 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CLDN23Q96B33 292 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 ACY3Q96HD9 319 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 YPEL4Q96NS1 127 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 SSX3Q99909 188 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 RARRES2Q99969 163 aa3.63□□□□□ -1.83
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USP25-210ENST00000549362 PKIBQ9C010 78 aa3.63□□□□□ -1.83
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USP25-210ENST00000549362 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CDH20Q9HBT6 801 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 MANBALQ9NQG1 85 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 NAT8Q9UHE5 227 aa3.63□□□□□ -1.83
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USP25-210ENST00000549362 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 UNC13CQ8NB66 2214 aa3.63□□□□□ -1.83
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USP25-210ENST00000549362 PCDH15Q96QU1 1955 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.62□□□□□ -1.83
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USP25-210ENST00000549362 CST7O76096 145 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 VENTXO95231 258 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 GCGP01275 180 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 IGKV1D-12P01611 117 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 LIPFP07098 398 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CCL3P10147 92 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 COX6A1P12074 109 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 B4GALT1P15291 398 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 OMGP23515 440 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CCKARP32238 428 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CDKN1AP38936 164 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 HAAOP46952 286 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 CXCL12P48061 93 aa3.62□□□□□ -1.83
USP25-210ENST00000549362 FHITP49789 147 aa3.62□□□□□ -1.83
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