RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 RNLSQ5VYX0 342 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 OR10K2Q6IF99 312 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 LCN12Q6JVE5 192 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 AHSA2Q719I0 299 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 Q8N1Y9 231 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 GGHQ92820 318 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 TMEM68Q96MH6 324 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 GAB2Q9UQC2 676 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 A0A0B4J203 849 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 BPNT1O95861 308 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 HTR2CP28335 458 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 MAP2K4P45985 399 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 BCAP31P51572 246 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 PSMD7P51665 324 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 WNT4P56705 351 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 RPEL1Q2QD12 228 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 PDPNQ86YL7 162 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 PHYHIPQ92561 330 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 PHB2Q99623 299 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 MND1Q9BWT6 205 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 NUPR2A6NF83 97 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 M0R1X1 148 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 MPPED1O15442 326 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 NAPSAO96009 420 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SYNJ2BPP57105 145 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 VBP1P61758 197 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 HLA-DRB3P79483 266 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 Q8N402 240 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SNAPC3Q92966 411 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 USMG5Q96IX5 58 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 TM2D1Q9BX74 207 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 COA4Q9NYJ1 87 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 PEMTQ9UBM1 199 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SSR3Q9UNL2 185 aa6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 A0A075B6Q4 140 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SHISA3A0PJX4 238 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SHOXO15266 292 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 TPPPO94811 219 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 PTTG1O95997 202 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 IGKV1-16P04430 117 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SRMP19623 302 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 IRF3Q14653 427 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 OXA1LQ15070 435 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 RTL8BQ17RB0 113 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ZNF383Q8NA42 475 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 BVESQ8NE79 360 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 PTX4Q96A99 478 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 MGLLQ99685 303 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 AGMATQ9BSE5 352 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 NICN1Q9BSH3 213 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 CCDC32Q9BV29 185 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 AK3Q9UIJ7 227 aa6.45□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 TRDCB7Z8K6 153 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 J3QRK9 145 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 UPK1BO75841 260 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 TUSC2O75896 110 aa6.44□□□□□ -1.38
TROAP-208ENST00000548817 ACTL6BO94805 426 aa6.44□□□□□ -1.38
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