RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRO-210	ENST00000544244	LGALS7	P47929	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	FGL1	Q08830	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244		A0A0B4J2A0	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	SLC31A2	O15432	143 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	LOXL3	P58215	753 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	PAX8	Q06710	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	MMD	Q15546	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244		Q6ZNX1	250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	GPR137B	O60478	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	GNB1	P62873	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	CD83	Q01151	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	SAA4	P35542	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	SNCA	P37840	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	MOS	P00540	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	VDAC1	P21796	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	DLX6	P56179	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	FCN2	Q15485	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	TIMM23	O14925	209 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	RAP2B	P61225	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	TCF23	Q7RTU1	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244		A0A087X0M5	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244		A0A1B0GX30	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRO-210	ENST00000544244	CD5L	O43866	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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