RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 PSMB6P28072 239 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 HERV-K104P61576 105 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 BDH1Q02338 343 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 PAX5Q02548 391 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 DHRS2Q13268 280 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 PMS2P11Q13670 270 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 LY6EQ16553 131 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-202ENST00000538886 HAX1O00165 279 aa7.34□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 CHRM2P08172 466 aa7.34□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PPOXP50336 477 aa7.34□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 CD81P60033 236 aa7.34□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.34□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PGA5P0DJD9 388 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 FAM166AQ6J272 317 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 MOB3BQ86TA1 216 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TP53RKQ96S44 253 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 METRNQ9UJH8 293 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 RNF222A6NCQ9 220 aa7.33□□□□□ -1.24
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GGA3-202ENST00000538886 ADAP1O75689 374 aa7.33□□□□□ -1.24
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GGA3-202ENST00000538886 ACTBP60709 375 aa7.33□□□□□ -1.24
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GGA3-202ENST00000538886 IQCJQ1A5X6 159 aa7.33□□□□□ -1.24
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GGA3-202ENST00000538886 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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GGA3-202ENST00000538886 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 RAB22AQ9UL26 194 aa7.33□□□□□ -1.24
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GGA3-202ENST00000538886 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.33□□□□□ -1.24
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GGA3-202ENST00000538886 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 MST1LQ2TV78 715 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 LYG1Q8N1E2 194 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 SVIPQ8NHG7 77 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 OR51I2Q9H344 312 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.32□□□□□ -1.24
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GGA3-202ENST00000538886 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 M0QZK8 103 aa7.32□□□□□ -1.24
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GGA3-202ENST00000538886 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TOX4O94842 621 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 KNG1P01042 644 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 VSIG8P0DPA2 414 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 CD37P11049 281 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 VAMP3Q15836 100 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 CR1LQ2VPA4 569 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 C18orf12Q96KH6 178 aa7.32□□□□□ -1.24
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GGA3-202ENST00000538886 FGF12P61328 243 aa7.32□□□□□ -1.24
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GGA3-202ENST00000538886 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.32□□□□□ -1.24
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GGA3-202ENST00000538886 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 CD74P04233 296 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 S100GP29377 79 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PNKDQ8N490 385 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ERGIC1Q969X5 290 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 A0A0A6YYH2 397 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 A6NJ64 397 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TUSC2O75896 110 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ACTL6BO94805 426 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TK1P04183 234 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 IGFBP2P18065 325 aa7.31□□□□□ -1.24
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