RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 ISOC1Q96CN7 298 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 C10orf35Q96D05 121 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 SEH1LQ96EE3 360 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 REEP6Q96HR9 211 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 COX14Q96I36 57 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 ITCHQ96J02 903 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 LINC00052Q96N35 136 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 OR52E6Q96RD3 313 aa2.89□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 CLN6Q9NWW5 311 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 SPRR3Q9UBC9 169 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 SS18L2Q9UHA2 77 aa2.89□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 U3KQ87 197 aa2.89□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 H0YL77 283 aa2.88□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 ORC5O43913 435 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 SOX15O60248 233 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 ENTPD6O75354 484 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 MMP23AO75900 390 aa2.88□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 MPZL1O95297 269 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 IGHG4P01861 327 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 IGKV3-11P04433 115 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 IFNW1P05000 195 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 ALDOBP05062 364 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 CRYBA1P05813 215 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 C8orf88P0DMB2 117 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 CD37P11049 281 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 UGT2B7P16662 529 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 KITLGP21583 273 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 FGF7P21781 194 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 ETV6P41212 452 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 PRLHRP49683 370 aa2.88□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 RAB25P57735 213 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 TAS2R43P59537 309 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 DEFA1P59665 94 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 DEFA3P59666 94 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 TPI1P60174 286 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 KRTAP10-1P60331 282 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 FABP9Q0Z7S8 132 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 SYPL1Q16563 259 aa2.88□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 ZNF620Q6ZNG0 422 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 RFLNAQ6ZTI6 216 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 IFNEQ86WN2 208 aa2.88□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 NEIL2Q969S2 332 aa2.88□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 PYURFQ96I23 114 aa2.88□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 SMIM14Q96QK8 99 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 OR7D2Q96RA2 312 aa2.88□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 V9GYS6 101 aa2.88□□□□□ -1.95
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PDE4D-220ENST00000512069 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 A0A087WXM4 84 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 MEIKINA0A087WXM9 373 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 A0A1B0GUS0 222 aa2.87□□□□□ -1.95
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