RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB25	P57735	213 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNG2	P59768	71 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	FXYD3	Q14802	87 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM65	Q6PI78	240 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARPC1A	Q92747	370 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	HARBI1	Q96MB7	349 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0A6YYH2	397 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014		A6NJ64	397 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	AIRE	O43918	545 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNFAIP8	O95379	198 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTXN2	P0C2S0	81 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF616	Q08AN1	781 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACTBL2	Q562R1	376 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNAPC3	Q92966	411 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHOX	O15266	292 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM127	O75204	238 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRYZL1	O95825	349 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	RRAS	P10301	218 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	RTL8B	Q17RB0	113 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOGA1	Q86XE5	327 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	RHOV	Q96L33	236 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	MS4A10	Q96PG2	267 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A087WW49	117 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	XRCC3	O43542	346 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV3-11	P01762	117 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR8U8	P0C7N1	319 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMIM18	P0DKX4	95 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLURP1	P55000	103 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBE2K	P61086	200 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS8	Q16651	343 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEX45	Q8NA69	505 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	BEST4	Q8NFU0	473 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR5T1	Q8NG75	326 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCUN1D4	Q92564	292 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPHA2	Q96T91	129 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	BRI3	O95415	125 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	FCER2	P06734	321 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	AADAC	P22760	399 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPPP2	P59282	170 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCS1	P62166	190 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	DGCR2	P98153	550 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCTD9	Q7L273	389 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	POC5	Q8NA72	575 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPF1	Q92782	380 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	SORL1	Q92673	2214 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC01619	G3V211	115 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014		H3BUA1	57 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	FCGR3B	O75015	233 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC22A5	O76082	557 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNIH1	O95406	144 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRGV3	P03979	118 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	FCGR2C	P31995	323 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEFA5	Q01523	94 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	DIABLO	Q9NR28	239 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GW64	132 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSGN1	A6NI15	193 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SH3BP2-222	ENST00000512014		E7EUB6	86 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SH3BP2-222	ENST00000512014	OVOL1	O14753	267 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAMP3	O60896	148 aa		9.77	□□□□□ -0.85

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.7 ms