RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
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PDE4D-218ENST00000509368 CAMK2N2Q96S95 79 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SPANXDQ9BXN6 97 aa1.59□□□□□ -2.15
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PDE4D-218ENST00000509368 RDH14Q9HBH5 336 aa1.59□□□□□ -2.15
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PDE4D-218ENST00000509368 PYCARDQ9ULZ3 195 aa1.59□□□□□ -2.15
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PDE4D-218ENST00000509368 G3V2T6 193 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 COPEO14579 308 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 SLC37A4O43826 429 aa1.59□□□□□ -2.16
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PDE4D-218ENST00000509368 FABP3P05413 133 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR1E2P47887 323 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 SLC18A1P54219 525 aa1.59□□□□□ -2.16
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PDE4D-218ENST00000509368 BIKQ13323 160 aa1.59□□□□□ -2.16
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PDE4D-218ENST00000509368 TMEM183BQ1AE95 376 aa1.59□□□□□ -2.16
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PDE4D-218ENST00000509368 LINC00173Q6ZV60 143 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM183AQ8IXX5 376 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF676Q8N7Q3 588 aa1.59□□□□□ -2.16
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PDE4D-218ENST00000509368 OR2AE1Q8NHA4 323 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 MCFD2Q8NI22 146 aa1.59□□□□□ -2.16
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PDE4D-218ENST00000509368 Q8WTZ3 238 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 BORCS7Q96B45 105 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 MRAP2Q96G30 205 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR7D2Q96RA2 312 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 GPER1Q99527 375 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 NRTNQ99748 197 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 MS4A8Q9BY19 250 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 SAMD10Q9BYL1 202 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 JPT1Q9UK76 154 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 SIGLEC7Q9Y286 467 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 TRAPPC4Q9Y296 219 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 SPTBN2O15020 2390 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 AKAP13Q12802 2813 aa1.59□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 CFAP46Q8IYW2 2715 aa1.59□□□□□ -2.16
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PDE4D-218ENST00000509368 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa1.58□□□□□ -2.16
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PDE4D-218ENST00000509368 I3L4J1 428 aa1.58□□□□□ -2.16
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PDE4D-218ENST00000509368 ATF1P18846 271 aa1.58□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 S100GP29377 79 aa1.58□□□□□ -2.16
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PDE4D-218ENST00000509368 SERPINB10P48595 397 aa1.58□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 CDKN2DP55273 166 aa1.58□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP1.58□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa1.58□□□□□ -2.16
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PDE4D-218ENST00000509368 ACP7Q6ZNF0 438 aa1.58□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 LINC00299Q6ZSB3 139 aa1.58□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 BLIDQ8IZY5 108 aa1.58□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 ATPAF2Q8N5M1 289 aa1.58□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 ACBD7Q8N6N7 88 aa1.58□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa1.58□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa1.58□□□□□ -2.16
PDE4D-218ENST00000509368 OR13C4Q8NGS5 318 aa1.58□□□□□ -2.16
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