RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 HSPA13P48723 471 aa12.44□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 DYRK1AQ13627 763 aa12.44□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 VMA21Q3ZAQ7 101 aa12.44□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM177Q53S58 311 aa12.44□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 IZUMO2Q6UXV1 221 aa12.44□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 SDHAF2Q9NX18 166 aa12.44□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 SCN3BQ9NY72 215 aa12.44□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 DENRO43583 198 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 AIREO43918 545 aa12.43□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 OR9G9P0C7N8 305 aa12.43□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 CLDN12P56749 244 aa12.43□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 TPBGQ13641 420 aa12.43□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 TNXAQ16473 311 aa12.43□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 PLAC9Q5JTB6 97 aa12.43□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 TEX45Q8NA69 505 aa12.43□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 OR2K2Q8NGT1 345 aa12.43□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 FAM3DQ96BQ1 224 aa12.43□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 GFI1Q99684 422 aa12.43□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 CEPT1Q9Y6K0 416 aa12.43□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 IZUMO1RA6ND01 250 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 ACTL6BO94805 426 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 TPPPO94811 219 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 HSMCR30P0CW71 290 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 CD81P60033 236 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 ATP5G2Q06055 141 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 TRAM1Q15629 374 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 C2orf76Q3KRA6 126 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 IGSF11Q5DX21 431 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 ACOT12Q8WYK0 555 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 RAB3CQ96E17 227 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 ADTRPQ96IZ2 230 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 PLEKHA3Q9HB20 300 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 SLC2A8Q9NY64 477 aa12.42□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 FAM223BA6NKX1 122 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 TUSC2O75896 110 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 GSTT2P0CG29 244 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 GSTT2BP0CG30 244 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 PSMD7P51665 324 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 UBE2KP61086 200 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 RHOGP84095 191 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 PRSS8Q16651 343 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM91Q6ZNR0 172 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 FAM223AQ8IWN6 122 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 DYNLRB2Q8TF09 96 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 NEURL2Q9BR09 285 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 GINS4Q9BRT9 223 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 CABLES2Q9BTV7 478 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 HIPK2Q9H2X6 1198 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 RETNQ9HD89 108 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 RAB22AQ9UL26 194 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 V9GY05 133 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 SACSQ9NZJ4 4579 aa12.41□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 DIRAS3O95661 229 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 CRYZL1O95825 349 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 FCGR3AP08637 254 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 CALRP27797 417 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 MECP2P51608 486 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 RPS25P62851 125 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 IDO2Q6ZQW0 420 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 LAX1Q8IWV1 398 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 SPIN2AQ99865 258 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 FAM110AQ9BQ89 295 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 CENPOQ9BU64 300 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 AKIP1Q9NQ31 210 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 BMPR1BO00238 502 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 PRH1P02810 166 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 GADD45AP24522 165 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 GUCA2BQ16661 112 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 RAB26Q9ULW5 256 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 KCNK7Q9Y2U2 307 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 TPRKBQ9Y3C4 175 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 A0A075B6Q4 140 aa12.38□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 DUTP33316 252 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 TALDO1P37837 337 aa12.38□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 IRF3Q14653 427 aa12.38□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 FAM209BQ5JX69 171 aa12.38□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 HES5Q5TA89 166 aa12.38□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 NECAP1Q8NC96 275 aa12.38□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 OR10R2Q8NGX6 335 aa12.38□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 MAFIPQ8WZ33 124 aa12.38□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 C5orf30Q96GV9 206 aa12.38□□□□□ -0.43
ITGA3-211ENST00000508100 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms