RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506401.6

ITGA3-207, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 1,817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-207ENST00000506401 SMCO1Q147U7 214 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 R3HDM4Q96D70 268 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 NABP2Q9BQ15 211 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 CRYZL1O95825 349 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 MMP9P14780 707 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 HTR1DP28221 377 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 ERVK-16P61578 105 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 KLRD1Q13241 179 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 Q5PR19 223 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF546Q86UE3 836 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 OR1S1Q8NH92 325 aa14.5□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 MARCH11A6NNE9 402 aa14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 LEUTXA8MZ59 168 aa14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 B4DSR2 109 aa14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 TXNL1O43396 289 aa14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 NQO2P16083 231 aa14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 CEACAM3P40198 252 aa14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 HCP5Q6MZN7 132 aa14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 RPEQ96AT9 228 aa14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 DPM3Q9P2X0 92 aa14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 H0YJW9 148 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 H7C2Y5 167 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 ST8SIA3O43173 380 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 HRASP01112 189 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 MSMBP08118 114 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 MC5RP33032 325 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 PAX8Q06710 450 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 TMEM65Q6PI78 240 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 RNF126Q9BV68 326 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 MBD2Q9UBB5 411 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 CACNG5Q9UF02 275 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 ODF3BA8MYP8 253 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 LY6LH3BQJ8 138 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 LGALS4P56470 323 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 LHX4Q969G2 390 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 TBX15Q96SF7 602 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 HSPB11Q9Y547 144 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.48□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 ARPC5O15511 151 aa14.47□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 PITX3O75364 302 aa14.47□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 P0C879 139 aa14.47□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 RAB13P51153 203 aa14.47□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 Q6ZRM9 215 aa14.47□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 PDPNQ86YL7 162 aa14.47□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 PDZD9Q8IXQ8 264 aa14.47□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.47□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 C1orf159Q96HA4 380 aa14.47□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 COA4Q9NYJ1 87 aa14.47□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.47□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 A0A096LNT2 108 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 H0YIZ8 118 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 K7EPK0 472 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 LYL1P12980 280 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 UBE2E1P51965 193 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 ARHGDIBP52566 201 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 ID3Q02535 119 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 SSX9Q7RTT3 188 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 MOB3BQ86TA1 216 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 DCUN1D4Q92564 292 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 REG4Q9BYZ8 158 aa14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ITGA3-207ENST00000506401 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.45□□□□□ -0.1
ITGA3-207ENST00000506401 A0A1W2PRD5 423 aa14.45□□□□□ -0.1
ITGA3-207ENST00000506401 A0A1W2PRF3 423 aa14.45□□□□□ -0.1
ITGA3-207ENST00000506401 A0A1W2PRM7 423 aa14.45□□□□□ -0.1
ITGA3-207ENST00000506401 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.45□□□□□ -0.1
ITGA3-207ENST00000506401 L7N2F9 121 aa14.45□□□□□ -0.1
ITGA3-207ENST00000506401 DEDDO75618 318 aa14.45□□□□□ -0.1
ITGA3-207ENST00000506401 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
ITGA3-207ENST00000506401 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.45□□□□□ -0.1
ITGA3-207ENST00000506401 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.45□□□□□ -0.1
ITGA3-207ENST00000506401 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms