RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	COL7A1	Q02388	2944 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325		H3BMQ9	156 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	CTDSP2	O14595	271 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPDEF	O95238	335 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	CRYZL1	O95825	349 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	CA2	P00918	260 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	VDAC1	P21796	283 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	FXYD4	P59646	89 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	COMMD1	Q8N668	190 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	HARBI1	Q96MB7	349 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	EHF	Q9NZC4	300 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF580	Q9UK33	172 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	SHOX	O15266	292 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	FCGR3B	O75015	233 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC22A5	O76082	557 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGHG4	P01861	327 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	RRAS	P10301	218 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	HLA-DMA	P28067	261 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	LGALS7	P47929	136 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	FOXE3	Q13461	319 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	DYRK1A	Q13627	763 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	RTL8B	Q17RB0	113 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCTD9	Q7L273	389 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	MFSD4A	Q8N468	514 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ISOC1	Q96CN7	298 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	SCOC	Q9UIL1	159 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	TNFSF12	O43508	249 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ELANE	P08246	267 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	PF4V1	P10720	104 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	PSMB8	P28062	276 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	CBX3	Q13185	183 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ECSCR	Q19T08	205 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	LAX1	Q8IWV1	398 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNF152	Q8N8N0	203 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABHD1	Q96SE0	405 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLK15	Q9H2R5	256 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZFP57	Q9NU63	452 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	SULT1C2	O00338	296 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	RGS5	O15539	181 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	SOX15	O60248	233 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGLV1-40	P01703	118 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	HRH1	P35367	487 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM17	Q86X19	198 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	TENM3	Q9P273	2699 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A1W2PN81	502 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	NUDT19	A8MXV4	375 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHRNA7	P36544	502 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	TAS2R46	P59540	309 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	HERV-K104	P61576	105 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	FXYD3	Q14802	87 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	MSMO1	Q15800	293 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	REC114	Q7Z4M0	266 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	LFNG	Q8NES3	379 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR52I2	Q8NH67	350 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		12.35	□□□□□ -0.43

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