RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 LRRC61Q9BV99 259 aa7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 DEPPQ9NTK1 212 aa7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 COL4A2P08572 1712 aa7.21□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 FAM166BA8MTA8 275 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RRHO14718 337 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SERPINE2P07093 398 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TCTAP57738 103 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SERF2P84101 59 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 GABRA6Q16445 453 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 UBALD1Q8TB05 177 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 GATA3P23771 443 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 UCP1P25874 307 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SRD5A2P31213 254 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR1D5P58170 312 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF542PQ5EBM4 170 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 LMX1AQ8TE12 382 aa7.21□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 MUC3AQ02505 3323 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SYNGR2O43760 224 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV1-5P01602 117 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 IGHMP01871 453 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 GP1BBP13224 206 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ZXDAP98168 799 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 FUT7Q11130 342 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SLAQ13239 276 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 GAB4Q2WGN9 574 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 DOK3Q7L591 496 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 MMD2Q8IY49 270 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PNKDQ8N490 385 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SPIN2AQ99865 258 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 WDR54Q9H977 334 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 BLACEA4D250 179 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 GAGE10A6NGK3 116 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 C2orf70A6NJV1 201 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TMPRSS2O15393 492 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CCL1P22362 96 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 DCAF12Q5T6F0 453 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 IL36BQ9NZH7 164 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 IL36GQ9NZH8 169 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SMPXQ9UHP9 88 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.2□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 C9orf172C9J069 976 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 EFNA2O43921 213 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 HAND1O96004 215 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 MT-ATP6P00846 226 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 GDF1P27539 372 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR5B3Q8NH48 314 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 BORCS7Q96B45 105 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 HES4Q9HCC6 221 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TNFSF14O43557 240 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TOX4O94842 621 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 FAM69BQ5VUD6 431 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 WDR82Q6UXN9 313 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PERPQ96FX8 193 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.19□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 C7orf71A4D174 169 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 H0Y8G0 127 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 M0R1X1 148 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PDCD6O75340 191 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SCGB2A2Q13296 93 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms