RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 SHOXO15266 292 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 SOX15O60248 233 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 HPGDSO60760 199 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 FCGR3BO75015 233 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 CRYZL1O95825 349 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 IGLV1-40P01703 118 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 CRYGBP07316 175 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 AADACP22760 399 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 SLC6A1P30531 599 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 MYCNOSP40205 109 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 CBX5P45973 191 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 LGALS7P47929 136 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 ALDH3B2P48448 385 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 RORCP51449 518 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 RAB25P57735 213 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 CBX3Q13185 183 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 TMEM177Q53S58 311 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 TMEM65Q6PI78 240 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 KCTD9Q7L273 389 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 GPR141Q7Z602 305 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 MINDY2Q8NBR6 621 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 LFNGQ8NES3 379 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 GRPEL2Q8TAA5 225 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 ARPC1AQ92747 370 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 OR5B12Q96R08 314 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 P2RX4Q99571 388 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 GNB4Q9HAV0 340 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 IFT46Q9NQC8 304 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.85□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 TNFSF12O43508 249 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 SLC22A5O76082 557 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 CNIH1O95406 144 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 PPYP01298 95 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 APOA1P02647 267 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 PMP2P02689 132 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 RRASP10301 218 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 ELK1P19419 428 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 PRSS3P35030 304 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 RAB9AP51151 201 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 FXYD4P59646 89 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 FXYD3Q14802 87 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 CDK10Q15131 360 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 ACTBL2Q562R1 376 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 IDO2Q6ZQW0 420 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 MS4A10Q96PG2 267 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 TAS2R8Q9NYW2 309 aa5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PATJ-211ENST00000493967 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 FAM25AB3EWG3 89 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 FAM25CB3EWG5 89 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 FAM25GB3EWG6 89 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 APELAP0DMC3 54 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 HLA-DMAP28067 261 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 RFX2P48378 723 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 UBE2KP61086 200 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 SPCS2Q15005 226 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 PRSS8Q16651 343 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 AKIRIN2Q53H80 203 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 TMEM17Q86X19 198 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 MFSD4AQ8N468 514 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 OR5T1Q8NG75 326 aa5.83□□□□□ -1.48
PATJ-211ENST00000493967 OR11H1Q8NG94 326 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms