RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 NLRC5Q86WI3 1866 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 M0R381 172 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 CXCR6O00574 342 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 ABCA8O94911 1581 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 IL3P08700 152 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM33P57088 247 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTS12P58397 1594 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 BAP18Q8IXM2 172 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 STRCP1A6NGW2 1772 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 SYNMO15061 1565 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 SOD1P00441 154 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 CRHBPP24387 322 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 CD200P41217 278 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 AMTNQ6UX39 209 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 DKKL1Q9UK85 242 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf51A8MQB3 221 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 MYL12AP19105 171 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 HOXC5Q00444 222 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf78Q8WTQ4 265 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35G5Q96KT7 338 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM109Q9BVC6 243 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 SPZ1Q9BXG8 430 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf84Q5VXU9 1444 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 LTBP2Q14767 1821 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf84H3BNL1 204 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2L6O14933 153 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 RPL12P30050 165 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC34Q8IZ02 419 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 TESCQ96BS2 214 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 TRPM6Q9BX84 2022 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 CACNA1AO00555 2505 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 SHPRHQ149N8 1683 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF878C9JN71 531 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 AHSA1O95433 338 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 CRYBB3P26998 211 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 FAM78BQ5VT40 261 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF767PQ75MW2 155 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 COMMD7Q86VX2 200 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 UBL4BQ8N7F7 174 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 RAB8BQ92930 207 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf95Q9H693 158 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf18Q9UK00 162 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 MYO9BQ13459 2157 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 EFCAB5A4FU69 1503 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 FGD6Q6ZV73 1430 aa3.53□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 UACAQ9BZF9 1416 aa3.53□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 HIVEP2P31629 2446 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0J9YX75 114 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 ODF3BA8MYP8 253 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 C21orf140B9A014 251 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 CTBP2P56545 445 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 BATFQ16520 125 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 COQ5Q5HYK3 327 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM31Q5JXX7 168 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 OR51I2Q9H344 312 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 RALGAPBQ86X10 1494 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 PLCH2O75038 1416 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 NAV1Q8NEY1 1877 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 MYO3AQ8NEV4 1616 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 NRKQ7Z2Y5 1582 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 CHD5Q8TDI0 1954 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 RICTORQ6R327 1708 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 OR6C6A6NF89 314 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 H3BPC8 53 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 ACOX3O15254 700 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC3O43617 180 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFB2O95178 105 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 ISG15P05161 165 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-DQB2P05538 268 aa3.51□□□□□ -1.85
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