RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489977.5

SKAP2-206, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-206ENST00000489977 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 SFXN4Q6P4A7 337 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 DOLPP1Q86YN1 238 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 Q8N402 240 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 OR10D3Q8NH80 312 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 ACY3Q96HD9 319 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 OR52B2Q96RD2 323 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 MIEN1Q9BRT3 115 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM208Q9BTX3 173 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 MROQ9BYG7 248 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM222Q9H0R3 208 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 OR51B6Q9H340 312 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 MAP1LC3AQ9H492 121 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 HRASLSQ9HDD0 168 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 USE1Q9NZ43 259 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 A0A1W2PP64 1363 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 ABCC11Q96J66 1382 aa1.05□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 NAV1Q8NEY1 1877 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 FNDC10F2Z333 226 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 SLC16A4O15374 487 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 ARL6IP5O75915 188 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 LYPLA2O95372 231 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 MT-CO2P00403 227 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 PRB1P04280 392 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 CTXN2P0C2S0 81 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 LINC00614P0C842 121 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 ESDP10768 282 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 ORM2P19652 201 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 RPS12P25398 132 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 DDTP30046 118 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 RPL12P30050 165 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 DAPP51397 102 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 CXCR4P61073 352 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 ERVS71-1P61550 626 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 LSM6P62312 80 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 HPCAP84074 193 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 PPP1R1AQ13522 171 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 LCN8Q6JVE9 175 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 LRRN1Q6UXK5 716 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 Q6ZTI0 123 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 C10orf67Q8IYJ2 551 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 OR1M1Q8NGA1 313 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 RAB8BQ92930 207 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 PRAP1Q96NZ9 151 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 PARVAQ9NVD7 372 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 EMC3Q9P0I2 261 aa1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 ARRDC5A6NEK1 342 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 LRRN3E7EW58 273 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 PFDN6O15212 129 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 ZW10O43264 779 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 GNRH2O43555 120 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 OCM2P0CE71 109 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 OR13C7P0DN81 318 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 CCL3P10147 92 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 CCL1P22362 96 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 ALDH3A1P30838 453 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 OR10J1P30954 320 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 CDKN2CP42773 168 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 CA7P43166 264 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 XCL1P47992 114 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 SULT1A2P50226 295 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 RANP62826 216 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 RPS24P62847 133 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 DEFA6Q01524 100 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 FOXF1Q12946 379 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 FADDQ13158 208 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 CST9Q5W186 159 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 ALKAL1Q6UXT8 129 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 LHFPL1Q86WI0 220 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM86BQ8N661 226 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 CLDND2Q8NHS1 167 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 JOSD2Q8TAC2 188 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 PIGXQ8TBF5 258 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 DHRS9Q9BPW9 319 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 CYSTM1Q9H1C7 97 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 OR51I1Q9H343 314 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 C16orf95Q9H693 158 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF532Q9HCE3 1301 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa1.03□□□□□ -2.24
SKAP2-206ENST00000489977 NCKAP5O14513 1909 aa1.03□□□□□ -2.25
SKAP2-206ENST00000489977 CHD5Q8TDI0 1954 aa1.03□□□□□ -2.25
SKAP2-206ENST00000489977 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa1.02□□□□□ -2.25
SKAP2-206ENST00000489977 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa1.02□□□□□ -2.25
SKAP2-206ENST00000489977 OR5K4A6NMS3 321 aa1.02□□□□□ -2.25
SKAP2-206ENST00000489977 KCNK1O00180 336 aa1.02□□□□□ -2.25
SKAP2-206ENST00000489977 SOD1P00441 154 aa1.02□□□□□ -2.25
SKAP2-206ENST00000489977 TCRBP04435 133 aa1.02□□□□□ -2.25
SKAP2-206ENST00000489977 ISG15P05161 165 aa1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms