RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SPTA1	P02549	2419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL21	O00585	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB29	O14966	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TXNL1	O43396	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNAB3	O43448	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFSF12	O43508	249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM50A	O95807	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TFF1	P04155	84 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SPP1	P10451	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	ZP3	P21754	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PPOX	P50336	477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB5C	P51148	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF266	Q14584	549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CXorf58	Q96LI9	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A087X0M5	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GX30	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00473	A8K010	186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247		F5H697	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SYNGR2	O43760	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CHST1	O43916	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	FCN3	O75636	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CLDN1	O95832	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	DANCR	P0C864	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	LPAR6	P43657	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF137P	P52743	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	DLX6	P56179	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL13	Q99616	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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