RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484908.1

ATP6AP1-208, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, human

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GINS4	Q9BRT9	223 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	VCX3B	Q9H321	246 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908		A0A075B6Q4	140 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SHISA3	A0PJX4	238 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MYL9	P24844	172 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR10A3	P58181	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908		Q6ZS49	121 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RAB3B	P20337	219 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TALDO1	P37837	337 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HSPA13	P48723	471 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ARFRP1	Q13795	201 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ARL6IP1	Q15041	203 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908		Q8N1Y9	231 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TEX45	Q8NA69	505 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DDB2	Q92466	427 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	USMG5	Q96IX5	58 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908		A8MZ25	164 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	UBE2K	P61086	200 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CASC10	Q5T4H9	136 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CNBD2	Q96M20	576 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PHB2	Q99623	299 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GAL	P22466	123 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PRSS8	Q16651	343 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908		A0A0B4J203	849 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	LINC00473	A8K010	186 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908		H0Y980	276 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CRYZL1	O95825	349 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DTYMK	P23919	212 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SYNJ2BP	P57105	145 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DEFA5	Q01523	94 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TNXA	Q16473	311 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TATDN3	Q17R31	274 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	APELA	P0DMC3	54 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RPEL1	Q2QD12	228 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	C22orf42	Q6IC83	251 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MPPED1	O15442	326 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TRBV12-3	P01733	135 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CDNF	Q49AH0	187 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SLC22A5	O76082	557 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CSN3	P07498	182 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	LYL1	P12980	280 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GABARAPL2	P60520	117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CDK10	Q15131	360 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HACD4	Q5VWC8	232 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MMD2	Q8IY49	270 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RAB26	Q9ULW5	256 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FAM223B	A6NKX1	122 aa		13.65	□□□□□ -0.22

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