RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 MINDY2Q8NBR6 621 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 SCPEP1Q9HB40 452 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 NOTCH3Q9UM47 2321 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 SHOXO15266 292 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 CRYZL1O95825 349 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 PMP2P02689 132 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 RFX2P48378 723 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 DYRK1AQ13627 763 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 MSMO1Q15800 293 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 DHRS11Q6UWP2 260 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 KCTD9Q7L273 389 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 MFSD4AQ8N468 514 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 WFDC9Q8NEX5 89 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 SECTM1Q8WVN6 248 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 MIXL1Q9H2W2 232 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 EHFQ9NZC4 300 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 EXTL2Q9UBQ6 330 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 ADAM30Q9UKF2 790 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 SULT1C2O00338 296 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 FCGR3BO75015 233 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 IGLV1-40P01703 118 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 BRWD1-AS2P59051 145 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 PJVKQ0ZLH3 352 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 ETV3LQ6ZN32 361 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R27Q86WC6 154 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 ZNF695Q8IW36 515 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 GPHA2Q96T91 129 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 KLK15Q9H2R5 256 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 NOTCH1P46531 2555 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 H3BMQ9 156 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 CTDSP2O14595 271 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 PF4P02776 101 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 HLA-DMAP28067 261 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A1P30531 599 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R46P59540 309 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 FXYD4P59646 89 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 UBE2KP61086 200 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 ECSCRQ19T08 205 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 ZNF66Q6ZN08 573 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 C8orf86Q6ZUL3 223 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB34Q8NCN2 500 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 OR5H2Q8NGV7 314 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 MYOZ3Q8TDC0 251 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 SLC5A7Q9GZV3 580 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R8Q9NYW2 309 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 SCOCQ9UIL1 159 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 A3GALT2U3KPV4 340 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 NUDT19A8MXV4 375 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 G3V4G9 280 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 FXYD3Q14802 87 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 VMA21Q3ZAQ7 101 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 OR2B11Q5JQS5 317 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 SAMD5Q5TGI4 173 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 C1QL4Q86Z23 238 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 TEX45Q8NA69 505 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 ABHD5Q8WTS1 349 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 ISOC1Q96CN7 298 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 CEPT1Q9Y6K0 416 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 TNFSF12O43508 249 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 SOX15O60248 233 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 TPPPO94811 219 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 HRH1P35367 487 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 DEFA6Q01524 100 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 AKIRIN2Q53H80 203 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 TMEM17Q86X19 198 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 LFNGQ8NES3 379 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 ARPC1AQ92747 370 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 ABHD1Q96SE0 405 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PN81 502 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 GNRHRP30968 328 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 RCVRNP35243 200 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 CHRNA7P36544 502 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 RAB9AP51151 201 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 IDO2Q6ZQW0 420 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 LAX1Q8IWV1 398 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 LINC00482Q8N8I6 264 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 ZNF491Q8N8L2 437 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 MOB3AQ96BX8 217 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 P2RX4Q99571 388 aa16.33■□□□□ 0.2
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