RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472033.1

ABCA4-205, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 4, human

TSL 3

Gene ABCA4, Length 470 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA4-205	ENST00000472033	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	SLC31A2	O15432	143 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	HSPA12A	O43301	675 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	LANCL1	O43813	399 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	NAPSA	O96009	420 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	IGHG2	P01859	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	GAL	P22466	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	ZBTB25	P24278	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	MYL9	P24844	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	VEGFC	P49767	419 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	UNC119	Q13432	240 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	P2RY14	Q15391	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	S1PR3	Q99500	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	ABCG5	Q9H222	651 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCA4-205	ENST00000472033	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	RAB29	O14966	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	SOCS1	O15524	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	RAB3B	P20337	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	GADD45A	P24522	165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	SLC6A1	P30531	599 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	MC5R	P33032	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	SOX6	P35712	828 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	CEACAM6	P40199	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	CLDN12	P56749	244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	HMGN3	Q15651	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	HES5	Q5TA89	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	STPG2	Q8N412	459 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033		Q8N6K4	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	GFI1	Q99684	422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	AK3	Q9UIJ7	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033		A0A0A6YYD4	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	CBY3	A6NI87	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	IFITM5	A6NNB3	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033		G3V4G9	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	CD3G	P09693	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	VDAC1	P21796	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	PSMB9	P28065	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	TALDO1	P37837	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	OR3A3	P47888	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	SERPINB10	P48595	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	F2RL1	P55085	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	TMEM50B	P56557	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	ACTB	P60709	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	GNMT	Q14749	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	MMD	Q15546	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	SSX1	Q16384	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCA4-205	ENST00000472033	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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