RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM65Q6PI78 240 aa15.56■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 KCTD9Q7L273 389 aa15.56■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 MINDY2Q8NBR6 621 aa15.56■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa15.56■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 A3GALT2U3KPV4 340 aa15.56■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 FCGR3BO75015 233 aa15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 IGLV1-40P01703 118 aa15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 CRYGBP07316 175 aa15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 RPL30P62888 115 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 C19orf54Q5BKX5 351 aa15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 SECTM1Q8WVN6 248 aa15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 GIMAP1Q8WWP7 306 aa15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 FAM25AB3EWG3 89 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 FAM25CB3EWG5 89 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 FAM25GB3EWG6 89 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 NAT1P18440 290 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 MYCNOSP40205 109 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 RPL5P46777 297 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 FXYD3Q14802 87 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 MSMO1Q15800 293 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 OXLD1Q5BKU9 147 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 OVCH2Q7RTZ1 564 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 SNX29P2Q8IUI4 249 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 MYOZ3Q8TDC0 251 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 GPX8Q8TED1 209 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 RAB2BQ8WUD1 216 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ARPC1AQ92747 370 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 KLK15Q9H2R5 256 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 SCPEP1Q9HB40 452 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 CCL28Q9NRJ3 127 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 TAS2R8Q9NYW2 309 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 EHFQ9NZC4 300 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 A0A1W2PN81 502 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 CNIH1O95406 144 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 CHRNA7P36544 502 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 TAS2R46P59540 309 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 FXYD4P59646 89 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 UBE2KP61086 200 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 PJVKQ0ZLH3 352 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 SPCS2Q15005 226 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 BEAN1Q3B7T3 259 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 VMA21Q3ZAQ7 101 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 AKIRIN2Q53H80 203 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 OR2B11Q5JQS5 317 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF66Q6ZN08 573 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 OR5H2Q8NGV7 314 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 GRPEL2Q8TAA5 225 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 SLC5A7Q9GZV3 580 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 PMP2P02689 132 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 IGLL1P15814 213 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 RFX2P48378 723 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 RAB9AP51151 201 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 TMBIM6P55061 237 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 HERV-K104P61576 105 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 GNB1P62873 340 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 DYRK1AQ13627 763 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ACTBL2Q562R1 376 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 MFSD4AQ8N468 514 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 TEX45Q8NA69 505 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB34Q8NCN2 500 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 LFNGQ8NES3 379 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 C4orf3Q8WVX3 66 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 UBE2E2Q96LR5 201 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 P2RX4Q99571 388 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 BCL7BQ9BQE9 202 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 TNCP24821 2201 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 CCL24O00175 119 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 SOX15O60248 233 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 DEFB136Q30KP8 78 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 DHRS11Q6UWP2 260 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 OR5M8Q8NGP6 311 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 OR4S2Q8NH73 311 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 RAX2Q96IS3 184 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 DUX3Q96PT4 197 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 GPHA2Q96T91 129 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 ADAM30Q9UKF2 790 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 VSIG4Q9Y279 399 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 SULT1C2O00338 296 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms