RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, human

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPC1-208	ENST00000469694	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	VWA1	Q6PCB0	445 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	GPR146	Q96CH1	333 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	VAMP8	Q9BV40	100 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	CHRNA7	P36544	502 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	MDP1	Q86V88	176 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	OR4F5	Q8NH21	305 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	BORCS8	Q96FH0	119 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	BTF3L4	Q96K17	158 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	RELN	P78509	3460 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	C20orf202	A1L168	122 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	TPPP2	P59282	170 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	SELENOT	P62341	195 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694		H0Y980	276 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	HSPB6	O14558	160 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	SLC25A6	P12236	298 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	IGHV1-2	P23083	117 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	CDKN1A	P38936	164 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	CCL25	O15444	150 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	NDUFB8	O95169	186 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	PLA2G5	P39877	138 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	LEMD1	Q68G75	181 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	TMEM42	Q69YG0	159 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	RPRML	Q8N4K4	120 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	EXTL1	Q92935	676 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	OR4C12	Q96R67	309 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	GTF3C1	Q12789	2109 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	MLNR	O43193	412 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	ADM	P35318	185 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	CDKN1B	P46527	198 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	PPP1CB	P62140	327 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	HBG1	P69891	147 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	HBG2	P69892	147 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	PLP2	Q04941	152 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	FOXL1	Q12952	345 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	MMD	Q15546	238 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694		Q6ZRM9	215 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	OR5T1	Q8NG75	326 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	SYNGR2	O43760	224 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	ESD	P10768	282 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	CD99	P14209	185 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	LINC00310	P59036	64 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694		Q6ZS49	121 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	SPSB4	Q96A44	273 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	AQP7	O14520	342 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	SCT	P09683	121 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	IAPP	P10997	89 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	ARR3	P36575	388 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	PTTG1IP	P53801	180 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
GPC1-208	ENST00000469694	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54

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