RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 DGCR2P98153 550 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 ARL6IP1Q15041 203 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 C9orf66Q5T8R8 295 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 C11orf87Q6NUJ2 197 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 ZNF562Q6V9R5 426 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 GVQW1Q8N7I0 195 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 DDB2Q92466 427 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 DCUN1D4Q92564 292 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 SCOCQ9UIL1 159 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 TRAV18A0A075B6X5 111 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 CNIH1O95406 144 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 CRYZL1O95825 349 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 OR8U8P0C7N1 319 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 ECI1P42126 302 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 LSM3P62310 102 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 RUNX1Q01196 453 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 RTL8BQ17RB0 113 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 AKIRIN2Q53H80 203 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 TMEM177Q53S58 311 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 OR5T1Q8NG75 326 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 GPHA2Q96T91 129 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa10.7□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 MEIS3P1A6NDR6 274 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 IGLV2-14P01704 120 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 TRGV3P03979 118 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 RPL30P62888 115 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 CBX3Q13185 183 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 ZNF645Q8N7E2 425 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 DCSTAMPQ9H295 470 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 ANXA10Q9UJ72 324 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 OR2W1Q9Y3N9 320 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 ETV7Q9Y603 341 aa10.69□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 LINC01619G3V211 115 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 OVOL1O14753 267 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 FCGR3BO75015 233 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 TUSC2O75896 110 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 SCGNO76038 276 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 LGALS7P47929 136 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 PITPNAQ00169 270 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 TNXAQ16473 311 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 CNIH2Q6PI25 160 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 KCTD9Q7L273 389 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 TSPAN14Q8NG11 270 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 YIPF6Q96EC8 236 aa10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 AIREO43918 545 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 HLA-DQB1P01920 261 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 RPS19P39019 145 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 VMA21Q3ZAQ7 101 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 C10orf55Q5SWW7 151 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 PYHIN1Q6K0P9 492 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 HAPLN4Q86UW8 402 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 POC5Q8NA72 575 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 BEST4Q8NFU0 473 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 ACOT12Q8WYK0 555 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 ADTRPQ96IZ2 230 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 RHOVQ96L33 236 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 PHB2Q99623 299 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 SPATA2Q9UM82 520 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 TNFSF12O43508 249 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 RAMP3O60896 148 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 SAP30O75446 220 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 LY86O95711 162 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 CTXN2P0C2S0 81 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 RRASP10301 218 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 AADACP22760 399 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 SCAND1P57086 179 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 ARPC4P59998 168 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 UBE2KP61086 200 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 CD69Q07108 199 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 SNAPC3Q92966 411 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 SLA2Q9H6Q3 261 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 AUNIPQ9H7T9 357 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 COA4Q9NYJ1 87 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 TAS2R8Q9NYW2 309 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 A0A087WXM4 84 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 ANKRD34BA5PLL1 514 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 MSGN1A6NI15 193 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 TNFAIP8O95379 198 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 CD40LGP29965 261 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 FCGR2CP31995 323 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 BRWD1-AS2P59051 145 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 PRSS8Q16651 343 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 HOGA1Q86XE5 327 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-209ENST00000439106 TEX45Q8NA69 505 aa10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms