RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 GDF1P27539 372 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 RPL34P49207 117 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 RBPJQ06330 500 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 LYZL2Q7Z4W2 148 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 SMIM8Q96KF7 97 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 NKX2-6A6NCS4 301 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 EML2O95834 649 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLAQ13239 276 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 APCDD1LQ8NCL9 501 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 FGF13Q92913 245 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 MRGPRFQ96AM1 343 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 CEACAM21Q3KPI0 293 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 CT83Q5H943 113 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 SMIM14Q96QK8 99 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 RARRES3Q9UL19 164 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 SNAI2O43623 268 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 B3GALT4O96024 378 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 SSR4P51571 173 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 NUBP1P53384 320 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 LINC01559Q495D7 138 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 SFTPA2Q8IWL1 248 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 SFTPA1Q8IWL2 248 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF479Q96JC4 524 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 A0A0G2JNG1 304 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 FCGR3BO75015 233 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 FCN3O75636 299 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 OR2A4O95047 310 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 NDUFA3O95167 84 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 CXCL10P02778 98 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 FOLR3P41439 243 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 TDGF1P3P51864 188 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 SELENOTP62341 195 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIR2DS5Q14953 304 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 CST6Q15828 149 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 VMA21Q3ZAQ7 101 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 OR4X1Q8NH49 305 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 OR2A7Q96R45 310 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIR2DL4Q99706 377 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 C19orf24Q9BVV8 132 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 HES7Q9BYE0 225 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 PRSS21Q9Y6M0 314 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 NBASA2RRP1 2371 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 PDCD6O75340 191 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 TIMP1P01033 207 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 ID4P47928 161 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 GNG3P63215 75 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 RTN4RQ9BZR6 473 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 PXMP4Q9Y6I8 212 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 K7ESF4 209 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 DHHO43323 396 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLC25A20O43772 301 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 SERF1AO75920 110 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCL5P13501 91 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 TSPOP30536 169 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 RGRP47804 291 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 RPS23P62266 143 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 C10orf111Q8N326 155 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 ST8SIA1Q92185 356 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 IP6K3Q96PC2 410 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 SIRT5Q9NXA8 310 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 M0QZQ0 153 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 ETHE1O95571 254 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 KLKB1P03952 638 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 C5orf47Q569G3 176 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM211Q6ICI0 200 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 FRRS1LQ9P0K9 344 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 SIGLEC7Q9Y286 467 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 H0YGG7 62 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 M0QZ24 198 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 CFIP05156 583 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 ADMP35318 185 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRZ1-201ENST00000393386 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106 ms