RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 RAB40BQ12829 278 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 GPR50Q13585 617 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 EBI3Q14213 229 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 CDK5R1Q15078 307 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 ZSCAN26Q16670 478 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 Q3ZCU0 254 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 ZFP1Q6P2D0 407 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 MOB3BQ86TA1 216 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 LINC00596Q86U02 117 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 STPG2Q8N412 459 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 STX19Q8N4C7 294 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 LINC00311Q8N616 119 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 C5orf56Q8N8D9 126 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 Q8NFD4 153 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 OR51A4Q8NGJ6 313 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 OR5M8Q8NGP6 311 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 OR2T10Q8NGZ9 312 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 OR10AC1Q8NH08 325 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 OR8U1Q8NH10 309 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 OR52N1Q8NH53 320 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 GPR148Q8TDV2 347 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 NEK7Q8TDX7 302 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 ARL11Q969Q4 196 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 RASL11BQ9BPW5 248 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 FAM192AQ9GZU8 254 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 METTL9Q9H1A3 318 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 GMPPBQ9Y5P6 360 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 MCRIP1C9JLW8 97 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 H0YHG0 523 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 DYNC1I1O14576 645 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 ORC5O43913 435 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 MOSP00540 346 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 IGHV3-7P01780 117 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 GTF2F2P13984 249 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 VDAC1P21796 283 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 DCKP27707 260 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 CD1BP29016 333 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 SOX6P35712 828 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 GNG10P50151 68 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 INSL3P51460 131 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 ALDH3A2P51648 485 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 MED21Q13503 144 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 GPR176Q14439 515 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 KIR2DS1Q14954 304 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 LTC4SQ16873 150 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 CCDC58Q4VC31 144 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 C6orf183Q5T699 404 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 LPCAT4Q643R3 524 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 TRAT1Q6PIZ9 186 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 ASCL4Q6XD76 172 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 LEAP2Q969E1 77 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 P2RX4Q99571 388 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 C9orf16Q9BUW7 83 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 ABCG5Q9H222 651 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM138Q9NPI0 162 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 IL36GQ9NZH8 169 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 GNG12Q9UBI6 72 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 CKLFQ9UBR5 152 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 LINC00527Q9UJ94 153 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 ING4Q9UNL4 249 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 ERGIC3Q9Y282 383 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 U3KQK5 164 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 A0A1W2PPE3 182 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 IRGMA1A4Y4 181 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms