RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PECRQ9BY49 303 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PPV4 95 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM82A0PJX8 343 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TEX46H3BTG2 121 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OVOL3O00110 214 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OVOL1O14753 267 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-48P01763 117 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IGFBP2P18065 325 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 LOXP28300 417 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GPR183P32249 361 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RAB2AP61019 212 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SSTP61278 116 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 LYZP61626 148 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H3AP68431 136 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RRN3P1Q2M238 152 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MST1LQ2TV78 715 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 C8orf86Q6ZUL3 223 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ETV7Q9Y603 341 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN9O75954 239 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ALX3O95076 343 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FGF2P09038 288 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 VSIG8P0DPA2 414 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR4A47Q6IF82 309 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.63□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 DPH3Q96FX2 82 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ATG101Q9BSB4 218 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 NMES1Q9C002 83 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF224Q9NZL3 707 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RABL2BQ9UNT1 228 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GTI1 187 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CCL24O00175 119 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ORC5O43913 435 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IAPPP10997 89 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ORM2P19652 201 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ARL3P36405 182 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CSN1S1P47710 185 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF137PP52743 207 aa3.63□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF45Q02386 682 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 LYZL4Q96KX0 146 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SC5DO75845 299 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IFNA7P01567 189 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ID1P41134 155 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 COMPP49747 757 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HERPUD1Q15011 391 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SPRNQ5BIV9 151 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR5H6Q8NGV6 325 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 METTL26Q96S19 204 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CTSZQ9UBR2 303 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TCF19Q9Y242 345 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PTHLHP12272 177 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ELK1P19419 428 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CFPP27918 469 aa3.62□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 MFAP4P55083 255 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SRPXP78539 464 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF616Q08AN1 781 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GUSBP1Q15486 140 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MSMPQ1L6U9 139 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB136Q30KP8 78 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TM4SF20Q53R12 229 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IGSF11Q5DX21 431 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.62□□□□□ -1.83
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