RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 GATA4P43694 442 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ERVFC1-1P60608 527 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 EFNB3Q15768 340 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 BSXQ3C1V8 233 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 FBLN7Q53RD9 439 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SLC35G3Q8N808 338 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR4S1Q8NGB4 309 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR4C16Q8NGL9 310 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 LRRC29Q8WV35 223 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ISOC2Q96AB3 205 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR6C3Q9NZP0 311 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 A0A0D9SG52 128 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 C17orf100A8MU93 164 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 F8WDY8 70 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CD74P04233 296 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CD55P08174 381 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 Q6P435 159 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 C12orf54Q6X4T0 127 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CLCC1Q96S66 551 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SIGMAR1Q99720 223 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 DEGS1O15121 323 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ACTL6BO94805 426 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR5G3P0C626 314 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PIGPP57054 158 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ZNF146Q15072 292 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TNXAQ16473 311 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 MST1LQ2TV78 715 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 HOGA1Q86XE5 327 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ASB13Q8WXK3 278 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 FXYD6Q9H0Q3 95 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 WDR13Q9H1Z4 485 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 M0QYG6 137 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SH2D1BO14796 132 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RAB5AP20339 215 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CFHR2P36980 270 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 UPRTQ96BW1 309 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 GCM1Q9NP62 436 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 MCRIP1C9JLW8 97 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SIRPB1O00241 398 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 HSPB6O14558 160 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR2H2O95918 312 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 HAND1O96004 215 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 KNG1P01042 644 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 FCGR3AP08637 254 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 IGFBP2P18065 325 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 EGR1P18146 543 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 AZU1P20160 251 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TESK1Q15569 626 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 FAM24BQ8N5W8 94 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 DMBX1Q8NFW5 382 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR4K15Q8NH41 348 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR56B4Q8NH76 319 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 Q8TCH9 128 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 HIST1H2BAQ96A08 127 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SLC35E1Q96K37 410 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 DYNLRB1Q9NP97 96 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 DOK5Q9P104 306 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SRRM5B3KS81 715 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TNFSF12O43508 249 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TUSC2O75896 110 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR2J3O76001 311 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 S1PR2O95136 353 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 LHBP01229 141 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SERPINE2P07093 398 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 AMY2BP19961 511 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 BRS3P32247 399 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 HRH1P35367 487 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CCL8P80075 99 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 MEF2DQ14814 521 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 KHDC3LQ587J8 217 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR5B12Q96R08 314 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.06□□□□□ -1.6
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