RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 CHRNA7P36544 502 aa14.27□□□□□ -0.12
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CLN3-241ENST00000635861 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
CLN3-241ENST00000635861 AKAP14Q86UN6 197 aa14.22□□□□□ -0.13
CLN3-241ENST00000635861 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
CLN3-241ENST00000635861 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
CLN3-241ENST00000635861 OR51E2Q9H255 320 aa14.22□□□□□ -0.13
CLN3-241ENST00000635861 KCNK15Q9H427 330 aa14.22□□□□□ -0.13
CLN3-241ENST00000635861 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa14.21□□□□□ -0.13
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