RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 NAPSAO96009 420 aa20.7■□□□□ 0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF880Q6PDB4 577 aa20.7■□□□□ 0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R1X1 148 aa20.69■□□□□ 0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 AIREO43918 545 aa20.69■□□□□ 0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 HTR2CP28335 458 aa20.69■□□□□ 0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R43P59537 309 aa20.69■□□□□ 0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-DRB3P79483 266 aa20.69■□□□□ 0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
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CAPNS1-217ENST00000629983 OR11H12B2RN74 326 aa20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
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CAPNS1-217ENST00000629983 PMS2P11Q13670 270 aa20.67■□□□□ 0.9
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CAPNS1-217ENST00000629983 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
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CAPNS1-217ENST00000629983 THRSPQ92748 146 aa20.66■□□□□ 0.9
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CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV2-23P01705 113 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CELP19835 753 aa20.65■□□□□ 0.9
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CAPNS1-217ENST00000629983 GLT8D1Q68CQ7 371 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF485Q8NCK3 441 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 PTX4Q96A99 478 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 TM2D1Q9BX74 207 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 MSGN1A6NI15 193 aa20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 TUSC2O75896 110 aa20.62■□□□□ 0.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 OR9G9P0C7N8 305 aa20.62■□□□□ 0.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 HERC2O95714 4834 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0A6YYD4 124 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM223BA6NKX1 122 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 PRH1P02810 166 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ST3GAL4Q11206 333 aa20.6■□□□□ 0.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 FAM223AQ8IWN6 122 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 CD1AP06126 327 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 FOLR2P14207 255 aa20.58■□□□□ 0.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 NUPR2A6NF83 97 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf70A6NJV1 201 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 EDN2P20800 178 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 ACSM3Q53FZ2 586 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRTM1Q86UE6 522 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 GGTLC1Q9BX51 225 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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