RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 BVESQ8NE79 360 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ENKURQ8TC29 256 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SSX3Q99909 188 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 NABP2Q9BQ15 211 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 PALMDQ9NP74 551 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 VSIG4Q9Y279 399 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 HIVEP2P31629 2446 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00473A8K010 186 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 H3BUX3 64 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CRLF1O75462 422 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFB6O95139 128 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 APOA2P02652 100 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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SGMS1-211ENST00000626236 CD24P25063 80 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 S100GP29377 79 aa6.85□□□□□ -1.31
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SGMS1-211ENST00000626236 BRS3P32247 399 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 THBS3P49746 956 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 PIGPP57054 158 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CATR1Q13166 79 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 Q6YL49 198 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF383Q8NA42 475 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 OR51H1Q8NH63 302 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CFHR4Q92496 578 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 COPZ2Q9P299 210 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 GPR132Q9UNW8 380 aa6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 RNF212BA8MTL3 300 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 VGLL3A8MV65 326 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 H0YJW9 148 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 H7C2Y5 167 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 VENTXO95231 258 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1D-33P01593 117 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1-33P01594 117 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV4-59P01825 116 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TCRBP04435 133 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 FAM157CP0CG43 387 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 FAM106CPP0CH98 169 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 AKR1C4P17516 323 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CD1BP29016 333 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 IER3P46695 156 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 RND3P61587 244 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CBX3Q13185 183 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 HES1Q14469 280 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 DDB2Q92466 427 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 NUDT15Q9NV35 164 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.84□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-211ENST00000626236 BTBD17A6NE02 478 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-211ENST00000626236 MPPED1O15442 326 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-211ENST00000626236 FCGR3BO75015 233 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-211ENST00000626236 PEX14O75381 377 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-211ENST00000626236 PTTG1O95997 202 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-211ENST00000626236 MOSP00540 346 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1-16P04430 117 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-211ENST00000626236 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM11P17152 192 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-211ENST00000626236 F2RP25116 425 aa6.83□□□□□ -1.32
SGMS1-211ENST00000626236 MC5RP33032 325 aa6.83□□□□□ -1.32
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