RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	OR7C2	O60412	319 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	TNFSF15	O95150	251 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	IGLV3-1	P01715	115 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	LINC00614	P0C842	121 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	PCP4	P48539	62 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	EDDM3B	P56851	147 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	ARG2	P78540	354 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	COL10A1	Q03692	680 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790		Q6ZS52	159 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	FGFRL1	Q8N441	504 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	SPSB4	Q96A44	273 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	STARD4	Q96DR4	205 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	SFRP2	Q96HF1	295 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	DIRC3	C9JPN6	131 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	PROB1	E7EW31	1015 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	ISLR	O14498	428 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF253	O75346	499 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	WNT2	P09544	360 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	PMCH	P20382	165 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	CA6	P23280	308 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	OPRK1	P41145	380 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	GAGE1	Q13065	139 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	PCOLCE	Q15113	449 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	HLA-B	Q31612	363 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF766	Q5HY98	468 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790		Q6ZN92	141 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF738	Q8NE65	137 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	DYRK2	Q92630	601 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	RAB1C	Q92928	201 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	SNURFL	B1AK76	121 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790		H3BMH7	237 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	IFNL4	K9M1U5	179 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	CHEK1	O14757	476 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	NAPSA	O96009	420 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	CXCL1	P09341	107 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	BMP5	P22003	454 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	TNFSF10	P50591	281 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	PTTG1IP	P53801	180 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	PDCD1	Q15116	288 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	TGIF1	Q15583	401 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	GUSBP11	Q6P575	273 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	NABP1	Q96AH0	204 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	C14orf144	Q96I85	54 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	IL36B	Q9NZH7	164 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790		A0A1W2PN81	502 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790		A0A1W2PPE3	182 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790		J3QR89	54 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790		M0R1X1	148 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	COX7A2P2	O60397	106 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	TYMS	P04818	313 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	NTF3	P20783	257 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	BMI1	P35226	326 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	PTGDS	P41222	190 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	ERVFRD-1	P60508	538 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	GNB2	P62879	340 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	HERPUD1	Q15011	391 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	PSMG4	Q5JS54	123 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	SARAF	Q96BY9	339 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMP1-216	ENST00000592790	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93

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