RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 KIR3DL3Q8N743 410 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 LY6G5BQ8NDX9 201 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 OR13D1Q8NGV5 346 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF596Q8TC21 504 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM168AQ92567 244 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFSF18Q9UNG2 199 aa18.59■□□□□ 0.57
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CAPNS1-212ENST00000591041 LY86O95711 162 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 LYL1P12980 280 aa18.58■□□□□ 0.56
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CAPNS1-212ENST00000591041 Q5BKY6 102 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 NMSQ5H8A3 153 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 FGFRL1Q8N441 504 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 IGFBPL1Q8WX77 278 aa18.58■□□□□ 0.56
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CAPNS1-212ENST00000591041 ONECUT1Q9UBC0 465 aa18.58■□□□□ 0.56
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CAPNS1-212ENST00000591041 FAM90A26D6RGX4 464 aa18.57■□□□□ 0.56
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CAPNS1-212ENST00000591041 ARL6Q9H0F7 186 aa18.57■□□□□ 0.56
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CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa18.55■□□□□ 0.56
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CAPNS1-212ENST00000591041 SLC31A2O15432 143 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 MMP23AO75900 390 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNA7P01567 189 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-7P01780 117 aa18.54■□□□□ 0.56
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CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A31Q9H0C2 315 aa18.54■□□□□ 0.56
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CAPNS1-212ENST00000591041 A8MXK9 166 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 FCN3O75636 299 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 MBPP02686 304 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 EPHA1P21709 976 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 CEACAM3P40198 252 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 P2RY1P47900 373 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 OR2B11Q5JQS5 317 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC51BQ86UW2 128 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 DMBX1Q8NFW5 382 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR146Q96CH1 333 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 R3HDM4Q96D70 268 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 AQP10Q96PS8 301 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB40CQ96S21 281 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 CLCC1Q96S66 551 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 GSX2Q9BZM3 304 aa18.53■□□□□ 0.56
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