RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	C17orf98	A8MV24	154 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM114	B3SHH9	223 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	LY6H	O94772	140 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	MT-CO2	P00403	227 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CD7	P09564	240 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC25A16	P16260	332 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	MYL12A	P19105	171 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	DDT	P30046	118 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	OR2F1	Q13607	317 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CST6	Q15828	149 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	RASL11A	Q6T310	242 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	DAND5	Q8N907	189 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	OR10A6	Q8NH74	314 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	MGLL	Q99685	303 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	UPK3B	Q9BT76	320 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	PECR	Q9BY49	303 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ADGRL1	O94910	1474 aa		2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM210	A6NLX4	147 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	TRAPPC3	O43617	180 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	IGLV6-57	P01721	117 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	AP3S2	P59780	193 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	NID2	Q14112	1375 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CEP170	Q5SW79	1584 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF550	Q7Z398	422 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM86B	Q8N661	226 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRC19	Q9H756	370 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	HHLA2	Q9UM44	414 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SNX12	Q9UMY4	172 aa		2.55	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CACNA1S	Q13698	1873 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	COL18A1	P39060	1754 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	OR6C6	A6NF89	314 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	TAS2R45	P59539	299 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SPCS3	P61009	180 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	AMTN	Q6UX39	209 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	KLK6	Q92876	244 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	NMNAT3	Q96T66	252 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	OR51I2	Q9H344	312 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	LCT	P09848	1927 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		2.54	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SDK2	Q58EX2	2172 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	DSCAM	O60469	2012 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1W2PNM2	257 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	COX7A2L	O14548	114 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CTXN2	P0C2S0	81 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CCL3	P10147	92 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	UCHL3	P15374	230 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	NPPC	P23582	126 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ATP6V0C	P27449	155 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	IFITM2	Q01629	132 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKRD7	Q92527	254 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SFRP2	Q96HF1	295 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CMTM6	Q9NX76	183 aa		2.53	□□□□□ -2

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