RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PPIAL4FP0DN26 164 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LIPCP11150 499 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 GABRR1P24046 479 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB25P24278 435 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 S100A11P31949 105 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TIMP3P35625 211 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ARR3P36575 388 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 RFC3P40938 356 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 RBP2P50120 134 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 H2BFSP57053 126 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ARPC4P59998 168 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ARG2P78540 354 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM3AP98173 230 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R1AQ13522 171 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC10A1Q14973 349 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR8B8Q15620 311 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MICBQ29980 383 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ALKBH6Q3KRA9 238 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CLLU1Q5K131 121 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PLCXD3Q63HM9 321 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM42Q69YG0 159 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52W1Q6IF63 320 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DPPA2Q7Z7J5 298 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SKA3Q8IX90 412 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OSR2Q8N2R0 312 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FGFRL1Q8N441 504 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF680Q8NEM1 530 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS33Q8NF86 280 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PXT1Q8NFP0 134 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TERB2Q8NHR7 220 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 COQ8AQ8NI60 647 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MARCH1Q8TCQ1 289 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MITD1Q8WV92 249 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 APH1AQ96BI3 265 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC7AQ9BXN2 247 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CHST6Q9GZX3 395 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FXYD6Q9H0Q3 95 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PPA2Q9H2U2 334 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LIME1Q9H400 295 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC7A10Q9NS82 523 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 EHFQ9NZC4 300 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DUX4Q9UBX2 424 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPRBP23467 1997 aa3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF462Q96JM2 2506 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0B4J2A0 478 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0D9SG52 128 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PPE3 182 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00862A6NCI5 91 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2AT4A6NND4 320 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CEACAM18A8MTB9 384 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 RRP8O43159 456 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNAB3O43448 404 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2F2O95006 317 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SFT2D2O95562 160 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MPC2O95563 127 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FCGR3AP08637 254 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PATE4P0C8F1 98 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PET100P0DJ07 73 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CD79AP11912 226 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A4P12235 298 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PGAM2P15259 253 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 AKR1C4P17516 323 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 HLA-GP17693 338 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CXCL2P19875 107 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DTYMKP23919 212 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 APLNRP35414 380 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 THBS3P49746 956 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM50BP56557 158 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ERVFC1-1P60608 527 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 UBA52P62987 128 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF92Q03936 586 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 KLRB1Q12918 225 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2F1Q13607 317 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF345Q14585 488 aa3.36□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TIGITQ495A1 244 aa3.36□□□□□ -1.87
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