RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 TATDN3Q17R31 274 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 RTL8BQ17RB0 113 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 C17orf58Q2M2W7 97 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 AADACL3Q5VUY0 350 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 Q6ZNX1 250 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 TMED4Q7Z7H5 227 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 CADM3Q8N126 398 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 LGI3Q8N145 548 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 ABHD12Q8N2K0 398 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 OR11H6Q8NGC7 330 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 OR4D10Q8NGI6 311 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 OR13C8Q8NGS7 320 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 OR8U1Q8NH10 309 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 RFESDQ8TAC1 157 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 MAFIPQ8WZ33 124 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 TOMM40LQ969M1 308 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 PPP1R14BQ96C90 147 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 GALNT14Q96FL9 552 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 SPIN2AQ99865 258 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 RNF5Q99942 180 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF581Q9P0T4 197 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 KCNS2Q9ULS6 477 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 NAV3Q8IVL0 2385 aa6□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.99□□□□□ -1.45
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SMAD4-210ENST00000590061 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 C7orf66A4D0T2 115 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 OR5H14A6NHG9 310 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 H0Y980 276 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 SSNA1O43805 119 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 APOA2P02652 100 aa5.99□□□□□ -1.45
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SMAD4-210ENST00000590061 SELLP14151 372 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 AKR1C4P17516 323 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 F2RP25116 425 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 GNRHRP30968 328 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 BRS3P32247 399 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 BTCP35070 178 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 DLX6P56179 175 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 LCN2P80188 198 aa5.99□□□□□ -1.45
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SMAD4-210ENST00000590061 MMP28Q9H239 520 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 OR51J1Q9H342 316 aa5.99□□□□□ -1.45
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SMAD4-210ENST00000590061 ABCA1O95477 2261 aa5.99□□□□□ -1.45
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SMAD4-210ENST00000590061 ZNF695Q8IW36 515 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 LYG1Q8N1E2 194 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 LRTM2Q8N967 370 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 OR4S2Q8NH73 311 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD4-210ENST00000590061 MALSU1Q96EH3 234 aa5.98□□□□□ -1.45
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